山羊CLAⅠα链基因的克隆及生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第7期北京时间：

作者：邓阳, 吴国华, 颜新敏, 赵志荀, 李杨, 李健, 窦永喜, 张志东, 张强

单位：中国农业科学院兰州兽医研究所, 家畜疫病病原生物学国家重点实验室, 农业部畜禽病毒学重点实验室, 兰州 730046

摘要：为探究山羊CLAⅠα链基因的多态性，本试验根据GenBank中山羊CLAⅠα链基因序列设计引物，采用RT-PCR技术从10个品系山羊白细胞中克隆山羊CLAⅠα链基因，测序后进行生物信息学分析。结果表明，CLAⅠα链基因长度为1 074 bp，编码357个氨基酸。经核苷酸序列分析发现，10个品系山羊CLAⅠα链基因同源性集中在82.8%~99.5%之间。将10个品系山羊CLAⅠα链基因核苷酸推导的氨基酸序列进行比对，发现突变集中在α1区域（22-110位氨基酸）与α2区域（111-203位氨基酸）。遗传进化分析表明，GenBank中山羊CLAⅠα链基因与红寺湖绒山羊、河西绒山羊、陕北绒山羊、阿尔巴斯绒山羊的CLAⅠα基因遗传关系较近，与其他6个品系山羊，即简阳大耳山羊、金堂黑山羊、西农萨能奶山羊、美姑山羊、大足黑山羊、努比亚山羊的CLAⅠα基因遗传关系较远。本试验结果为进一步研究CLAⅠα链基因的多态性奠定了理论基础。

关键词：山羊;CLAⅠ&alpha')">CLAⅠα链基因;克隆;生物信息分析

基金资助：甘肃省国际科技合作专项（1604WKCA012）；甘肃省科技支撑计划（1504NKCA054-3）；"十三五"国家重点研发计划（2016YFD0500907）