藏羊白细胞介素-7基因的PCR扩增及生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第9期北京时间：

作者：张晓芬, 冶贵生

单位：1. 青海大学, 省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室, 西宁 810016;2. 青海大学农牧学院动物医学系, 西宁 810016

摘要：为了获得藏羊白细胞介素-7（interleukin-7，IL-7）基因序列，并研究其序列特征及编码蛋白的结构和功能，本试验采用RT-PCR方法，从藏羊脾脏中扩增了IL-7基因，应用DNAStar软件分析该基因的核苷酸和氨基酸序列，与经BLAST比对后的参考序列进行同源性比对，并构建系统进化树，同时利用DNAStar软件和在线服务器预测该基因编码蛋白的二级结构、三级结构、亲水性、信号肽和蛋白翻译后修饰位点。结果表明，藏羊IL-7基因长度为531 bp（含终止密码子），编码176个氨基酸。藏羊IL-7基因与绵羊、山羊、藏羚羊、水牛、瘤牛、美洲草原野牛、黄牛和牦牛的IL-7基因核苷酸序列同源性在97.2%~99.8%之间，氨基酸序列同源性在94.9%~99.4%之间，藏羊与绵羊的亲缘关系最近。蛋白结构预测结果表明，IL-7蛋白主要由α螺旋组成，是一种亲水性和分泌型蛋白。该蛋白含有6种蛋白质翻译后修饰位点，包括1个N-豆蔻酰化位点、1个酰胺化位点、1个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点、3个N-糖基化位点、4个蛋白激酶C磷酸化位点、6个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点。本研究结果可为藏羊IL-7基因的进一步研究与临床应用提供参考。

关键词：藏羊;IL-7基因')">IL-7基因;RT-PCR;序列分析;蛋白结构预测

基金资助：青海省科技厅项目（2016-ZJ-738）