利用16S rDNA扩增子测序技术分析不同品种猪盲肠微生物菌落多样性

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第11期北京时间：

作者：康润敏, 李瑶, 吕学斌, 姬高升, 应三成, 曾凯, 李琰, 殷明郁

单位：1. 四川省畜牧科学研究院, 动物遗传育种四川省重点实验室, 成都 610066;2. 四川大学生命科学学院, 动物疫病防控与食品安全四川省重点实验室, 生物资源与生态环境教育部重点实验室, 成都 610064

摘要：为了研究中国特有地方猪种丫杈猪、青裕猪和乌金猪盲肠微生物菌落的组成，揭示地方猪种耐粗饲特性的机理，本试验采用16S rDNA扩增子测序技术比较分析了体重90 kg左右的丫杈猪、青裕猪和乌金猪盲肠微生物菌群的多样性。结果显示，在门水平上3个品种猪的核心菌群均为拟杆菌门（Bacteroidetes）和厚壁菌门（Firmicutes），在属的水平上均为普雷沃菌属（Prevotella）和拟杆菌属（Bacteroides）；在3个猪种的盲肠中均发现了与降解纤维素相关的细菌，其中纤维杆菌属（Fibrobacter）和梭菌属（Clostridium）在丫杈猪盲肠中的数量显著高于青裕猪和乌金猪（P<0.05），普雷沃氏菌属（Prevotella）在丫杈猪盲肠内的数量显著高于乌金猪（P<0.05），拟杆菌属（Bacteroides）在青裕猪盲肠内的数量显著高于丫杈猪（P<0.05），螺旋体门（Spirochaetes）在青裕猪盲肠内的数量显著高于乌金猪（P<0.05）。结果表明，3个品种猪盲肠内微生物菌群分布的种类相似度高，但分布规律和数量存在显著差异；对与纤维素消化相关菌群的分析表明，丫杈猪对纤维消化的能力是3个品种中最强的，其次是青裕猪，乌金猪最弱。

关键词：丫杈猪;青裕猪;乌金猪;盲肠;微生物多样性;纤维素消化能力

基金资助：四川公益性科研院所基本科研项目（SASA2015A03）；四川省科技支撑计划（2016NYZ0042、2014NZ0092、16ZC2850）；国家生猪产业技术体系（CARS-36）；四川省财政运行专项（SASA2014CZYX001）