不同生物型BVDV感染宿主细胞后差异基因分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第11期北京时间：

作者：程凯慧, 朱彤, 侯佩莉, 王洪梅, 苗自利, 张亮, 解晓莉, 杨宏军, 何洪彬

单位：山东省农业科学院奶牛研究中心, 济南 250131

摘要：为深入研究牛场中普遍存在的持续性感染，探讨不同生物型牛病毒性腹泻病毒（bovine viral diarrhea virus，BVDV）转化的分子机制，本试验将致细胞病变型BVDV （CP型BVDV）和非致细胞病变型BVDV （NCP型BVDV）感染MDBK细胞，观察细胞变化，感染后12~72 h期间每间隔12 h收集1次细胞，同时对24、48 h收集的细胞进行转录组学分析。结果显示，不同生物型BVDV感染宿主细胞24 h后，与感染NCP型BVDV的细胞相比，感染CP型BVDV的MDBK细胞中上调差异表达的基因2 849个，下调差异表达的基因3 347个，48 h后，上调差异表达的基因2 933个，下调差异表达的基因2 831个。对差异基因的GO功能分析结果表明，差异基因参与的分子功能主要有催化活性、结合活性、酶调节活性、分子转导活性和蛋白结合转录因子活性等；Pathway显著性富集分析结果显示，差异表达基因主要参与细胞自噬、细胞凋亡、免疫调节因子等相关的信号通路。本试验结果可为进一步揭示病毒致病的分子机制、控制BVDV和研制其候选疫苗奠定基础。

关键词：致细胞病变型BVDV;非致细胞病变型BVDV;差异基因;GO功能分析;Pathway显著性分析

基金资助：十三五国家重点研发计划（2016YFD0500904）；山东省优秀中青年科学家科研奖励基金（BS2014SW008）；现代农业（奶牛）产业技术体系科学家岗位（CARS-36）；山东省农科院青年基金（2014QNM17）；山东省自然基金（ZR2016CP09）；山东省农业科学院农业科技创新工程（CXGC2016B14、CXGC2016A10）