中国荷斯坦牛PIK3CB基因多态性及其与繁殖和产奶性状的关联分析

来源：中国畜牧兽医杂志2022年第9期北京时间：

作者：徐昊祺, 许静漪, 胡丽蓉, 张帆, 罗汉鹏, 张海亮, 师睿, 李想, 刘林, 刘巧香, 郭刚, 王雅春

单位：1. 中国农业大学动物科技学院, 农业农村部动物遗传育种与繁殖(家畜)重点实验室, 畜禽育种国家工程实验室, 北京 100193;2. 北京奶牛中心, 北京 100192;3. 北京生物种业创新联合体, 北京 101206;4. 北京首农畜牧发展有限公司, 北京 100029

摘要：【目的】 探究磷脂酰肌醇-4，5-二磷酸3-激酶催化亚单位β（PIK3CB）基因多态性及其与中国荷斯坦牛繁殖和产奶性状的关系。【方法】 通过混池测序对中国荷斯坦牛PIK3CB基因进行单核苷酸多态性（SNP）位点筛选，采用竞争性等位基因特异性PCR （KASP）技术在1 160头健康泌乳中国荷斯坦牛中进行SNP分型并进行群体遗传学分析，采用线性模型进行SNP与11个繁殖和产奶性状基于单位点和单倍型组合的关联分析。【结果】 在PIK3CB基因中共检测到了17个SNPs，筛选出7个SNPs用于后续分析。关联分析发现，7个SNPs与多个目标性状存在显著或极显著的关联（PA位点GG基因型个体，其经产牛首末次配种间隔、产奶量、乳蛋白量和乳脂量最低，体细胞评分最高，上述基因型个体具有较短的首末次配种间隔，而产奶性能相对较差；g.130387717 G>A位点AA基因型个体，其初配日龄和青年牛首末次配种间隔最低，产奶量、乳蛋白量和乳脂量最高，该基因型个体的繁殖和产奶性能均较好，上述3个SNPs位点可作为中国荷斯坦牛繁殖和产奶性状的候选位点重点关注。单倍型分析发现，PIK3CB基因的g.130387717 G>A、g.130430832 A>－、g.130433743 A>G、g.130433982 C>T、g.130446073 C>T和g.130448069 G>A 6个SNPs紧密连锁形成一个单倍型块，且与多个目标性状存在显著或极显著关联（PG、g.130448069 G>A和g.130387717 G>A位点可作为潜在分子标记，为中国荷斯坦牛的平衡育种提供理论依据。

关键词：中国荷斯坦牛;PIK3CB基因')">PIK3CB基因;单核苷酸多态性(SNP);繁殖性状;产奶性状

基金资助：北京三元种业科技股份有限公司自立科研课题（SYZYZ20190005）；国家现代农业产业技术体系（CARS-36）；长江学者和创新团队发展计划（IRT_15R62）；西藏自治区区域协同创新专项（QYXTZX-LS2021-01）