北京黑猪MYH3和MYH13基因多态性与肉质性状的关联分析

来源：中国畜牧兽医杂志2022年第9期北京时间：

作者：杨曼, 刘海, 张润, 胡紫平, 牛乃琪, 王立贤, 张龙超

单位：1. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 农业农村部动物遗传育种与繁殖(家禽) 重点实验室, 北京 100193;2. 北京黑六牧业科技有限公司, 北京 102211

摘要：【目的】 试验旨在研究肌球蛋白重链3（myosin heavy chain 3，MYH3）和肌球蛋白重链13（myosin heavy chain 13，MYH13）基因遗传变异对猪肉质性状的影响。【方法】 利用北京黑猪背最长肌样本进行肉质性状（肌内脂肪（intramuscular fat，IMF）、水分、滴水损失、酸碱度（pH）、肉色L*值、肉色a*值和肉色b*值）表型数据的测定。利用PCR和Sanger测序技术对MYH3和MYH13基因启动子区和CDS区进行基因分型。将性别、场、日龄作为协变量，采用协方差分析，确定与猪肉质性状相关的SNPs，利用实时荧光定量PCR检测基因表达水平。【结果】 试验共筛选到9个SNPs，其中MYH3基因CDS区有1个错义突变（c.5782 G>C）与IMF显著相关（PA、c.1308 G>A）与肉色a*值显著相关，1个（c.963 G>A）与滴水损失显著相关，1个（c.237 G>T）与肉色L*值显著相关（P<0.05）；MYH13基因启动子区有4个SNPs，其中2个（rs699287502、rs318639161）与肉色L*值显著相关，2个（rs321315318、rs330770991）与滴水损失显著相关（P<0.05），且MYH13基因表达水平与滴水损失呈负相关。【结论】 MYH3基因有1个SNP与IMF显著相关，且其基因表达水平与IMF呈正相关。MYH13基因中存在3个SNPs与滴水损失显著相关，且该基因启动子区2个SNPs基因表达水平与滴水损失呈负相关；3个SNPs与肉色L*值显著相关；2个SNPs与肉色a*值显著相关。以上SNPs均可作为影响北京黑猪肉质性状的候选基因功能位点。

关键词：北京黑猪;MYH3基因')">MYH3基因;MYH13基因')">MYH13基因;肉质性状

基金资助：国家重点研发计划（2021YFD1301101）；中国农业科学院科技创新工程（ASTIP-IAS02）；国家生猪产业技术体系（CARS-35）