大白猪ZnT基因家族生物信息学分析及组织表达研究

来源：中国畜牧兽医杂志2022年第11期北京时间：

作者：李月月, 吕冬玲, 刘笑笑, 田威龙, 梁靓, 陈奎蓉, 程锋, 兰干球, 梁晶

单位：广西大学动物科学技术学院, 南宁 530004

摘要：【目的】 分析大白猪溶质载体30A （ZnT）基因家族成员的生物学特性，并检测其在猪不同组织中的表达水平，为研究ZnT基因家族调控锌的代谢提供科学依据。【方法】 使用多种生物信息学软件对猪ZnT基因家族10个成员（ZnT1~ZnT10）进行序列分析，包括基序、保守结构域、跨膜结构域、进化树、蛋白相互作用分析；使用实时荧光定量PCR方法检测ZnT基因家族在6月龄大白猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢、乳腺中的表达差异。【结果】 ZnT1~ZnT10基因定位到猪的8条染色体上，分子质量在41.61~85.30 ku之间；等电点介于6.27~9.30之间，其中ZnT6等电点最高为9.30，ZnT1等电点最低为6.27。ZnT基因家族中，除ZnT3外都属于稳定蛋白，除ZnT5、ZnT9外都含有6层跨膜结构域，除ZnT6、ZnT9外所含基序顺序均一致，Cation-efflux是ZnT基因家族共有的保守结构域。ZnT6与ZnT2、ZnT3、ZnT7、ZnT9蛋白关联程度最高，ZnT1与ZnT3蛋白关联程度最高，ZnT8与其他家族成员间关系较远。ZnT基因家族序列在哺乳动物进化过程中相对保守。ZnT基因家族的10个基因在大白猪肺脏中相对表达量较高，在心脏中相对表达量较低，除ZnT5、ZnT7、ZnT9外的ZnT基因家族的其他成员在肌肉中几乎不表达。【结论】 ZnT家族属于跨膜结构蛋白，所含基序顺序基本一致，Cation-efflux是ZnT基因家族共有的保守结构域。ZnT基因家族多数成员在大白猪肺脏中表达量最高，在心脏和肌肉中相对表达量较低。

关键词：大白猪;ZnT基因家族')">ZnT基因家族;生物信息学分析;组织表达

基金资助：国家自然科学基金"广西巴马小型猪2型糖尿病易感性相关lncRNA的筛选及机制研究"（81860150）；国家现代农业产业技术体系广西生猪产业创新团队建设项目（nycytxgxcxtd-15-01）