《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析

不同种群白纹伊蚊单倍型多态性、遗传分化及种系发育关系分析

来源:中国畜牧兽医杂志2023年第4期北京时间:

作者:李中波, 侯强红, 段德勇

单位:1. 怀化职业技术学院, 怀化 418000;2. 湖南农业大学动物医学院, 长沙 410128

摘要:【目的】试验旨在探究湖南怀化地区不同种群白纹伊蚊单倍型多态性、遗传分化情况及种系发育关系。【方法】于湖南怀化地区采集30只白纹伊蚊样本,PCR扩增其核糖体18S rRNA及线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cox1)基因部分序列。利用ClustalX软件对其变异位点进行分析;运用Dnasp 5.0、Network 4.6及Arlequin version 3.0软件进行单倍型多态性与遗传分化分析;利用PhyML 3.0及Mega 5.0软件对白纹伊蚊的种系发育关系进行分析。【结果】所获全部样本的18S rRNA和cox1基因序列长度均为489和1004 bp。白纹伊蚊18S rRNA基因序列中共存在30个变异位点,17个单倍型(A1~A17,Hd=0.9149),其中单倍型A5为最古老的单倍型,白纹伊蚊18S rRNA的基因分化系数(Gst)、遗传分化系数(Fst)和基因流(Nm)分别为0.05614、0.24001和0.792;白纹伊蚊的cox1基因序列中共存在2个变异位点,3个单倍型(B1~B3,Hd=0.1908),其中单倍型B1为最古老的单倍型,白纹伊蚊cox1基因的Gst、Fst和Nm分别为0.05000、0.04762和4.999。系统发育树中,来源于怀化地区的30只白纹伊蚊均分别处于2个发育树的一个分支。【结论】来源于湖南怀化地区的白纹伊蚊个体和种群之间存在一定程度基因变异和单倍型多态性现象,但各单倍型及其个体之间具有较近的亲缘关系,且两种群白纹伊蚊个体间发生了较为频繁的基因交流,未出现遗传分化。

关键词:白纹伊蚊;单倍型多态性;基因流;遗传分化;种系发育关系

基金资助:国家自然科学基金青年项目(31902294);湖南省自然科学基金青年项目(2020JJ5230);湖南省教育厅项目(21C1443);湖南省自然科学基金项目(2022JJ50319);湖南省怀化市科学技术局项目(2020R3107)

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