《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析
作者:张新越, 孙娜, 孙盼盼, 张华, 范阔海, 尹伟, 孙耀贵, 李宏全
单位:1. 山西农业大学动物医学学院, 中兽医药现代化山西省重点实验室, 太谷 030801;2. 山西农业大学实验动物管理中心, 太谷 030801
摘要:【目的】基于网络药理学和分子对接方法探讨野黄芩苷抗卵泡闭锁的作用机制,以筛选野黄芩苷抗玉米赤霉烯酮(zearalenone,ZEA)致颗粒细胞损伤的作用途径。【方法】利用PharmMapper、TCMSP、SymMap和GeneCards数据库获得野黄芩苷发挥抗卵泡闭锁作用的靶点,使用Cytoscape v 3.7.2软件构建靶蛋白互作网络关系图并筛选关键靶点;利用DAVID数据库对靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析,构建药物-靶点-通路网络图;使用AutoDock Tools 1.5.6软件进行分子对接验证。【结果】共获得34个交集靶点,筛选得到胰岛素样生长因子1受体(insulin-like growth factor 1 receptor,IGF1R)、丝裂原活化激酶3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)、G1/S-特异性周期蛋白-D1(G1/S-specific cyclin-D1,CCND1)、纤连蛋白1(fibronectin 1,FN1)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、半胱天冬酶-3(caspase-3,CASP3)、神经源性基因位点切口同源物蛋白1(neurogenic locus notch homolog protein 1,NOTCH1)和白细胞介素6(interleukin 6,IL6)共9个核心靶点。GO功能富集分析得到基因表达调控、细胞增殖正调控、凋亡过程负调控等264个生物过程条目;线粒体、内质网、细胞质等25个细胞组分条目;生长因子活性、蛋白质结合、细胞外基质结构组成等23个分子功能条目。KEGG通路富集分析得到癌症通路、IL17信号通路、PI3K-Akt信号通路等115条相关通路。分子对接验证结果显示,野黄芩苷与9个核心靶点蛋白的结合能均<0 kJ/mol,说明蛋白可与野黄芩苷自发结合。【结论】野黄芩苷可能通过多靶点、多通路来治疗卵泡闭锁,本研究结果可为阐明野黄芩苷抗ZEA致颗粒细胞损伤的作用机制提供思路。
关键词:网络药理学;分子对接;野黄芩苷;卵泡闭锁
基金资助:中央引导地方科技发展资金项目(YDZJSX2021A035);山西省重点研发计划项目(202102140601019)