柔嫩艾美耳球虫MIF基因克隆及生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2023年第6期北京时间：

作者：李永彬, 杨惠琳, 宋子豪, 张昱, 杨瑾, 孟佳, 崔小珍, 吕晓玲, 郑明学, 白瑞

单位：山西农业大学动物医学学院, 太谷 030801

摘要：【目的】克隆柔嫩艾美耳球虫巨噬细胞迁移抑制因子（macrophage migration inhibitory factor，MIF）基因CDS区，探究其生物信息学特征，为后续抗原表位筛选提供理论依据。【方法】采集晋中地区疑似柔嫩艾美耳球虫感染的阳性样本进行PCR鉴定，根据GenBank中公布的柔嫩艾美耳球虫MIF基因序列，利用RT-PCR技术扩增MIF基因CDS区，构建pET28a-EtMIF重组质粒，经PCR和双酶切鉴定后测序并进行序列分析；利用生物信息学软件对其编码蛋白的理化性质、结构和功能等进行预测。【结果】成功克隆了柔嫩艾美耳球虫MIF基因CDS区序列，全长348 bp，共编码115个氨基酸，相对分子质量为1.203×104。系统进化树结果表明，柔嫩艾美耳球虫MIF基因氨基酸序列与毒害艾美耳球虫的亲缘关系最近，相似性为98.3%。MIF蛋白为非跨膜、可溶性、非分泌型蛋白，亚细胞定位主要在细胞质中，共有10个磷酸化位点；含有1个保守结构域，二级结构由无规则卷曲（35.65%）、延伸链（30.43%）、α-螺旋（27.83%）和β-转角（6.09%）组成，三级结构预测结果与二级结构一致。存在3个最佳潜在抗原表位。【结论】本试验成功克隆出柔嫩艾美耳球虫MIF基因，并对其进行了生物信息学分析，为今后MIF基因的功能研究及基因工程疫苗候选分子的筛选提供参考。

关键词：柔嫩艾美耳球虫;MIF基因')">MIF基因;生物信息学

基金资助：晋中市科技重点研发计划（Y212010）；国家自然科学基金项目（31602029）；山西省自然科学研究面上项目（202103021224165）