松辽黑猪HBEGF基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

来源：中国畜牧兽医杂志2023年第6期北京时间：

作者：张方玮, 张琪, 雷亮亮, 孙武胜, 张迪, 张云鹏, 张净搏, 王修权, 张晶, 张树敏

单位：1. 吉林农业大学动物科学技术学院, 长春 130118;2. 吉林省农业科学院动物生物技术研究所, 公主岭 136100;3. 公主岭国家农业科技园飞马斯牧业有限公司, 公主岭 136100;4. 公主岭市市区动物检疫所, 公主岭 136100;5. 吉林大学动物科学学院, 长春 130062

摘要：【目的】分析肝素结合型表皮生长因子样生长因子（heparin-binding EGF-like growth factor，HBEGF）基因单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）位点在松辽黑猪中的遗传多样性及其与繁殖性状的相关性。【方法】选择90头健康经产松辽黑猪母猪，采用Sanger直接测序法检测HBEGF基因的SNP位点，利用SPSS 26.0软件分析HBEGF基因SNP位点与松辽黑猪繁殖性状（总产仔数、产活仔数、初生重、3周龄重、断奶重、断奶仔猪数和乳头数）的相关性。【结果】在松辽黑猪HBEGF基因第5外显子及第2、3、4、5内含子上共发现22个SNPs位点，其中有8个SNPs位点与繁殖性状存在显著关联。g.142114384 A>G和g.142104389_142104388ins A>G位点存在AA、AG和GG 3种基因型；g.142114375 C>A位点存在CC、CA和AA 3种基因型；g.142111433 C>T位点存在CC和CT 2种基因型；g.142106003 G>A和g.142105707_142105706ins G>A位点存在GG、GA和AA 3种基因型；g.142105965 C>G位点存在CC、CG和GG 3种基因型；g.142105878_142105877ins C>T位点存在CC、CT和TT 3种基因型。卡方适合性检验结果显示，g.142114375 C>A、g.142111433 C>T和g.142104389_142104388ins A>G位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。g.142114384 A>G、g.142114375 C>A、g.142106003 G>A、g.142105878_142105877ins C>T和g.142104389_142104388ins A>G位点均为中度多态（0.25G和g.142105707_142105706ins G>A位点均为低度多态（PICG位点AA基因型个体总产仔数、产活仔数、断奶仔猪数均显著高于GG基因型，GG基因型个体初生重显著高于AG基因型，GG基因型个体乳头数显著高于AA、AG基因型（PA位点AA基因型个体总产仔数、产活仔数均显著高于CC基因型（P<0.05），AA基因型个体断奶仔猪数显著高于CC、CA基因型（PT位点CC基因型个体乳头数显著高于CT基因型（PA位点GG基因型个体乳头数显著高于AA基因型（PG位点CC、GG基因型个体总产仔数、产活仔数和断奶仔猪数均显著高于CG基因型（PT位点CC、TT基因型个体断奶仔猪数显著高于CT基因型，TT基因型个体乳头数显著高于CC基因型（PA位点AA基因型个体3周龄重和断奶重均显著高于GG基因型（PG位点AG基因型个体总产仔数、产活仔数均显著高于AA基因型（P<0.05）。【结论】HBEGF基因中存在8个SNPs位点，与松辽黑猪总产仔数、产活仔数、初生重、3周龄重、断奶重、断奶仔猪数和乳头数均有显著关联。

关键词：松辽黑猪;HBEGF基因')">HBEGF基因;繁殖性状;关联分析;遗传标记

基金资助：国家自然科学基金（U21A20251）