竹鼠源细小病毒分离鉴定及全基因组序列分析

来源：中国畜牧兽医杂志2023年第7期北京时间：

作者：唐海波, 姜佳佳, 陈凤莲, 杨锦兰, 白安斌, 刘金凤, 覃绍敏, 吴健敏

单位：1. 广西壮族自治区兽医研究所, 广西兽医生物技术重点实验室, 南宁 530001;2. 广西中医药大学, 广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室, 南宁 530001;3. 南宁市动物疫病预防控制中心, 南宁 530001

摘要：【目的】了解并掌握广西地区竹鼠细小病毒（Bamboo rat parvovirus，BRPV）的生物学特性及遗传变异情况，为BRPV的防控提供理论依据和技术支撑。【方法】用养殖场患病死亡的竹鼠病料制备组织上清液，采用Vero细胞同步接毒法进行病毒分离，通过细胞病变观察、PCR、透射电镜观察及血凝试验等方法鉴定，设计合成特异性扩增引物对BRPV全基因组序列进行测序分析。【结果】分离获得的病毒可在Vero细胞上稳定生长增殖，感染细胞变长、变梭或成拉丝状；病毒纯化后经电镜观察可见呈立体对称、无囊膜、直径20~25 nm的病毒粒子；经PCR鉴定、凝集试验及全基因组测序表明，分离株为BRPV。本研究共获得3株BRPV （GenBank登录号：MF497824、MF497825、MF497826），毒株基因组全长约4 758 bp，全基因组序列比对发现，其与蝙蝠源细小病毒关系较近。BRPV基因编码氨基酸遗传特征与其宿主特异性有很强的相关性，NS1基因编码氨基酸变异与蝙蝠及大鼠源细小病毒更接近，与其处于同一分支，核苷酸相似性为96.9%~97.6%，氨基酸相似性为97.5%~98.4%。其中第257和360位氨基酸属于高突变位点；基于VP2基因编码氨基酸的遗传进化树显示，其进化树处在一个独立的分支上，与大鼠源及犬、猫等动物源细小病毒核苷酸相似性为58.3%~66.8%，氨基酸相似性为51.6%~63.0%。VP2蛋白第8、99、114、118、247和253位氨基酸存在宿主偏好性，第53和386位氨基酸属于高突变位点。【结论】本研究分离获得的BRPV为一种细小病毒，本研究结果明确了中国BRPV遗传特性及病毒粒子形态特征，为BRPV的流行病学调查及防控奠定了基础。

关键词：竹鼠细小病毒(BRPV);分离鉴定;全基因组;遗传进化分析

基金资助：国家自然科学基金项目（31260830）；广西水产畜牧局科技推广应用项目（桂渔牧科201452004）；广西基本科研业务费专项（桂科专项15-4）