秦川牛PLAG1基因启动子克隆及转录因子预测

来源：中国畜牧兽医杂志2023年第7期北京时间：

作者：马勇, 陈宗昌, 李旭鹏, 李静生, 白彦斌, 刘占鑫, 魏亚丽, 郭达山, 石斌刚, 赵志东, 罗玉柱, 胡江, 王继卿, 刘秀, 李少斌

单位：甘肃农业大学动物科学技术学院, 甘肃省草食动物生物技术重点实验室, 兰州 730070

摘要：【目的】探究秦川牛多形性腺瘤基因1（pleomorphic adenoma gene 1，PLAG1）的组织表达规律，并克隆其启动子区序列，预测分析其关键转录因子结合位点，为探究其转录调控机制提供理论参考。【方法】采集3头20月龄秦川牛成年公牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最长肌、瘤胃组织，用实时荧光定量PCR方法检测PLAG1基因在不同组织中的相对表达量，同时克隆PLAG1基因上游启动子区序列，利用生物信息学软件预测PLAG1基因转录起始位点及启动子核心区域，分析、筛选核心启动子区域的关键转录因子结合位点。【结果】PLAG1基因在秦川牛各组织中均有表达，且在背最长肌中的表达量显著高于其他组织（P<0.05）。PLAG1基因启动子序列全长1 861 bp，生物信息学预测分析发现PLAG1基因核心启动子区位于-297―＋42 bp，存在高度保守的Krüppel样因子5（KLF5）、cAMP反应元件结合蛋白1（CREB1）和早期生长反应因子1（EGR1）转录因子结合位点，且CpG岛位于PLAG1基因核心启动子区域内。【结论】PLAG1基因在肌肉组织中高表达，其核心启动子区位于-297―＋42 bp，KLF5、CREB1和EGR1转录因子对PLAG1基因的转录活性可能具有调控作用。本研究结果为进一步探究PLAG1基因的转录调控机制提供了理论依据。

关键词：秦川牛;PLAG1基因')">PLAG1基因;启动子;转录因子

基金资助：甘肃农业大学科技创新基金-青年导师扶持基金（GAU-QDFC-2022-07）；甘肃农业大学学科团队项目（GAU-XKTD-2022-22）；国家自然科学基金地区项目（31860631）