怀化地区犬瘟热病毒H、F基因遗传多样性及其遗传进化分析

来源：中国畜牧兽医杂志2023年第8期北京时间：

作者：罗世民, 李中波

单位：怀化职业技术学院, 怀化 418000

摘要：【目的】探究怀化地区犬瘟热病毒的基因变异与遗传多样性情况,阐明其遗传进化关系。【方法】从怀化地区收集30株犬源犬瘟热病毒样本,用PCR法扩增其H、F基因序列。利用DNAStar软件分析H、F基因序列碱基组成;利用Clustal X、MegAlign软件进行变异位点和遗传多样性分析;运用Clustal X、PhyML 3.0软件,采用最大似然法(ML)对怀化地区犬瘟热病毒进行遗传进化分析,并用FigTree v 1.3.1软件构建遗传进化树。【结果】30株怀化地区犬瘟热病毒均为Asia-Ⅰ型,其H、F基因序列长度分别为1 778和1 850 bp,其AT含量分别为56.8%~57.9%和54.9%~56.1%,GC含量分别为42.2%~43.0%和44.1%~44.9%。H基因的种内差异为0~3.1%,种间差异为51.36%~60.15%;F基因的种内差异为0~2.4%,种间差异为39.60%~53.09%。基于H、F基因序列所构建的遗传进化树发现,来源于怀化地区的30株犬源犬瘟热病毒全部位于遗传进化树的同一分支上。【结论】来源于怀化地区犬瘟热病毒之间虽存在一定程度的基因变异和遗传多样性,但它们之间的亲缘关系较近。且其H、F基因序列的种内差异小、种间差异大,是研究犬瘟热病毒基因变异、遗传多样性和遗传进化的重要遗传标记。

关键词：犬瘟热病毒;H基因')">H基因;F基因')">F基因;基因变异;遗传多样性

基金资助：湖南省怀化市科学技术局项目(2020R3107);湖南省教育厅项目(21C1443);湖南省科技厅项目(2022JJ50319)