陕北白绒山羊Notch2基因多态性与绒毛和生长性状的相关性分析

来源：中国畜牧兽医杂志2023年第9期北京时间：

作者：白晶晶, 刘晓宇, 刘丽娜, 宋岩峰, 张昕, 宋晓越, 史雷, 李陇平, 张磊, 朱海鲸, 屈雷

单位：1. 榆林学院, 陕西省陕北白绒山羊工程技术研究中心, 榆林 719000;2. 府谷县动物疫病预防控制中心, 榆林 719000

摘要：【目的】探究陕北白绒山羊Notch2基因插入/缺失(insertion/deletion,InDel)遗传多态性及其与绒毛和生长性状的相关性,为陕北白绒山羊分子辅助育种提供理论依据。【方法】采集1 469只成年雌性陕北白绒山羊耳组织,提取基因组DNA,并测定绒长、毛长、体长、体高等绒毛与生长性状数据。参考GenBank和Ensembl数据库提供的山羊Notch2基因InDel遗传变异信息设计引物,利用PCR扩增和直接测序法检测Notch2基因17个InDels突变的多态性,并分析其与陕北白绒山羊绒毛和生长性状的相关性。【结果】陕北白绒山羊Notch2基因分别在第15内含子区的12 bp InDel(rs665021370)和第25内含子区的21 bp InDel(rs653705114)存在多态性,且2个InDels位点均存在插入/插入型(II)、杂合型(ID)和缺失/缺失型(DD)3种基因型,这2个位点均属于低度多态(P＜0.25),且处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05)。关联分析结果表明,Notch2基因rs665021370位点突变与陕北白绒山羊体高或体长呈显著或极显著相关(P＜0.05;P＜0.01);rs653705114位点突变与陕北白绒山羊毛长、胸宽和体高呈显著或极显著相关(P＜0.05;P＜0.01)。2个InDels位点不属于强连锁关系。【结论】Notch2基因rs665021370和rs653705114位点突变对陕北白绒山羊绒毛或生长性状有显著影响,可作为陕北白绒山羊优良性状选育的分子标记。

关键词：陕北白绒山羊;Notch2基因')">Notch2基因;InDel;多态性;相关性

基金资助：榆林学院研究生创新基金(2022YLYCX11);国家自然科学基金(32060734);陕西省科技统筹创新工程计划(2014KTDZ02);陕西省教育厅项目重点项目(22JY075);陕西省科技资源开放共享平台(2021PT-017)