乏情和发情初产母猪下丘脑-垂体轴中miRNA表达谱比较分析

来源：中国畜牧兽医杂志2023年第11期北京时间：

作者：任巧玲, 张家庆, 王璟, 陈俊峰, 马强, 高彬文, 刘付玖, 邢宝松

单位：河南省农业科学院畜牧兽医研究所, 河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室, 郑州 450002

摘要：【目的】从神经内分泌系统揭示微小RNA（microRNA，miRNA）调控初产母猪情期活动的遗传机制。【方法】利用RNA-Seq技术对乏情和发情初产母猪下丘脑-垂体轴中的small RNA进行测序，获得了母猪下丘脑和垂体miRNA表达谱，并对筛选的差异表达miRNA进行GO和KEGG等功能分析。【结果】从所构建的4个文库中共鉴定出1 096个miRNAs，其中已知miRNAs 364个，新预测miRNAs 732个。以发情母猪为对照，在乏情母猪的下丘脑有16个miRNAs存在差异表达，其中6个上调，10个下调；在乏情母猪垂体有9个miRNAs存在差异表达，其中2个上调，7个下调。下丘脑中16个差异表达miRNAs共预测到5 212个靶基因，垂体中9个差异表达miRNAs共预测到6 897个靶基因。下丘脑中靶基因主要在细胞投射组装、质膜结合的细胞投射组装、神经元投射发育的负调控、蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性等GO条目及Ras信号通路、神经营养因子信号通路、ErbB信号通路、mTOR信号通路等KEGG信号通路中显著富集；垂体中靶基因主要在mRNA加工调控、Ras GTP酶结合、泛素样蛋白连接结酶活性、表皮生长因子受体结合等GO条目及蛋白激酶、鞘脂类信号通路、凋亡、ErbB信号通路、NF-κB信号通路等KEGG信号通路中显著富集。从构建的差异表达miRNAs与生殖相关功能靶基因的调控网络中，筛选的Chr3_8404_mature、ssc-miR-9和ssc-miR-34c可能在下丘脑-垂体轴中对初产母猪情期活动的调控起重要作用。下丘脑和垂体各选4个差异表达miRNAs进行实时荧光定量PCR验证，其表达趋势与测序结果基本一致。【结论】本研究成功构建了乏情和发情初产母猪下丘脑-垂体轴miRNA的表达谱，并对差异表达miRNA的功能进行了深度挖掘，筛选到了3个对初产母猪情期活动起重要作用的miRNAs，为初产母猪情期活动遗传机制的解析提供了miRNAs方面的理论依据。

关键词：miRNA;乏情;发情;初产母猪;下丘脑-垂体轴

基金资助：河南省科技攻关项目（222102110096）；河南省农业科学院自主创新项目（2023ZC053）；河南省农业科学院科技创新团队项目（2023TD22）；国家重点研发计划项目（2021YFD1301200）