黄麻羽肉鸡β-防御素基因AvBD1和AvBD2克隆、生物信息学分析及组织表达

来源：中国畜牧兽医杂志2023年第11期北京时间：

作者：康丹菊, 彭秋云, 周嘉欣, 陈进军, 林红英, 周光现

单位：广东海洋大学滨海农业学院, 湛江 524088

摘要：【目的】防御素是生物体内产生的具有广谱抗微生物作用的活性肽。深入认识鸡β-防御素AvBD1和AvBD2的基本信息，有助于进一步研究和应用其生物学功能。【方法】采用PCR方法扩增黄麻羽肉鸡AvBD1和AvBD2基因并克隆测序，将测序获得的CDS序列推导成氨基酸序列后进行相似性比对，利用在线软件分析所预测蛋白的生物信息学特性，并探究二者在黄麻羽肉鸡不同组织中的表达情况。【结果】黄麻羽肉鸡AvBD1和AvBD2基因CDS区大小分别为198和195 bp，可编码65和64个氨基酸，二者CDS区序列相似度为56%，氨基酸序列相似度为36%，可见二者并非同源基因。系统进化树表明，黄麻羽肉鸡与其他几个品种鸡的亲缘关系较近，其中AvBD1基因与小鼠亲缘关系最远；AvBD2基因与大山雀亲缘关系最远。生物信息学分析结果显示，AvBD1和AvBD2均为疏水性蛋白，且AvBD1疏水性和稳定性均强于AvBD2，均存在信号肽，但所处氨基酸位点不同，无跨膜结构域，二级结构主要元件分别为α-螺旋和无规则卷曲，但参与形成这2种构象的氨基酸比例差异较大。实时荧光定量PCR分析发现，AvBD1和AvBD2基因在黄麻羽肉鸡心脏、肝脏、肺脏、肾脏和十二指肠组织中整体表达趋势相似，均以肺脏中表达量最高，十二指肠中表达量最低。【结论】试验成功克隆了黄麻羽肉鸡AvBD1和AvBD2基因CDS区全长序列，分析了AvBD1和AvBD2蛋白的结构和功能，二者在黄麻羽肉鸡内脏组织中的mRNA表达趋势一致，为进一步阐明AvBD1和AvBD2的生物学功能及其在生产中的应用提供参考依据。

关键词：黄麻羽肉鸡;AvBD1基因')">AvBD1基因;AvBD2基因')">AvBD2基因;克隆;序列分析;组织表达

基金资助：广东省级大学生创新创业训练计划项目（S202210566033）；广东海洋大学博士启动基金（R20045、R19066）；2020年广东省一流专业-动物医学（010306052102）；广东省研究生教育创新计划项目-联合培养研究生示范基地：广东海洋大学-正大（湛江）现代农业投资有限公司广东省联合培养研究生示范基地（230420081）