美仁牦牛MYL9基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究

来源：中国畜牧兽医杂志2024年第4期北京时间：

作者：马荣, 喇永福, 包鹏甲, 郭宪, 路建卫, 扎老, 赵雪, 梁春年, 成述儒

单位：1. 甘肃农业大学, 兰州 730070;2. 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所, 甘肃省牦牛繁育工程重点实验室, 农业农村部青藏高原畜禽遗传资源育种重点实验室, 兰州 730050;3. 合作市佐盖多玛乡畜牧站, 合作 747000;4. 合作市农畜产品质量安全检测检验中心, 合作 747000

摘要：【目的】克隆美仁牦牛肌球蛋白轻链9(myosin light chain 9,MYL9)基因CDS区并对其进行生物信息学分析,检测MYL9基因的组织表达特征,为探究该基因功能提供一定理论依据。【方法】以美仁牦牛肌肉组织cDNA为模板,利用PCR扩增并克隆美仁牦牛CDS区序列,与其他物种进行相似性比对及系统进化树构建;通过在线软件对MYL9蛋白进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR检测MYL9基因在美仁牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中表达情况。【结果】美仁牦牛MYL9基因CDS区长516 bp,共编码171个氨基酸。系统进化树结果显示,美仁牦牛与野牦牛、普通牛亲缘关系最近,与高山倭蛙亲缘关系最远。MYL9蛋白分子式为C858H1324N234O274S12,原子数为2 702,理论等电点为4.85,不稳定系数和总平均亲水性分别为37.22和―0.772,属于稳定亲水性蛋白。MYL9蛋白无信号肽和跨膜螺旋结构,属于非分泌性蛋白;主要定位于线粒体、细胞核、细胞质中,具有17个特异性磷酸化位点。MYL9蛋白二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲、β-折叠和延伸链构成,三级结构预测结果与二级结构一致。实时荧光定量PCR结果显示,MYL9基因在美仁牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中均表达,且肝脏和肌肉组织中表达量显著高于其他组织(P＜0.05)。【结论】本研究成功克隆美仁牦牛MYL9基因CDS区,探究了MYL9基因的生物学功能及组织表达特征,研究结果为进一步探究牦牛MYL9基因功能特征提供了参考。

关键词：美仁牦牛;MYL9基因')">MYL9基因;克隆;生物信息学;组织表达

基金资助：合作市牦牛种质提升与提质增效项目;现代肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37);甘肃省基础研究创新群体项目(20JR5RA580);甘肃省科技重大专项(21ZD10NA001,GZGG-2021-1);中国农业科学院创新工程(25-LIHPS-01)