ALDH7A1和EDNRB2基因分型及其与乌骨鸡皮肤乌色度关联分析

来源：中国畜牧兽医杂志2024年第7期北京时间：

作者：屠云洁, 栾德琴, 章明, 巨晓军, 刘一帆, 单艳菊, 姬改革, 邹剑敏, 束婧婷, 赵伟东, 郑国庆

单位：1. 江苏省家禽科学研究所, 江苏省家禽遗传育种重点实验室, 农业农村部畜禽资源(家禽)评价利用重点实验室, 扬州 225125;2. 泰和凤升农牧科技有限公司, 吉安 343700;3. 国家知识产权局专利局专利审查协作江苏中心, 苏州 215163

摘要：【目的】为进一步验证醛脱氢酶7家族成员A1(ALDH7A1)和内皮素受体B2(EDNRB2)在乌骨鸡黑色素沉积中的作用,本研究对ALDH7A1和EDNRB2基因单核苷酸多态性(SNPs)位点进行基因分型,分析其多态位点与皮肤乌色度的关联性,找出对皮肤乌色度有显著效应的SNP标记,为培育乌色度高的屠宰型乌骨鸡肉鸡的分子标记辅助育种提供参考。【方法】采用基于飞行时间质谱对丝羽乌骨鸡192个个体的ALDH7A1和EDNRB2基因SNPs位点进行基因分型,采用HaploView 4.1软件分析这些SNPs位点的连锁不平衡(LD)程度,并分析不同基因型和单倍型与皮肤亮度(L*)值的相关性。【结果】ALDH7A1基因的2个SNPs位点(rs317018616 C＞A和rs15992676 T＞C,分别为SNP1和SNP2)和EDNRB2基因2个SNPs位点(rs739725493 G＞A和rs316614064 C＞T,分别为SNP3和SNP4)质谱检出率为100%,ALDH7A1基因2个SNPs位点只有2种纯合子基因型,EDNRB2基因2个SNPs位点都有3种基因型。卡方检验表明,ALDH7A1基因2个SNPs位点偏离Hardy-Weinberg平衡(P＜0.05),EDNRB2基因2个SNPs位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05)。SNP1位点遗传多样性较低(PIC＜0.25),其他3个SNPs位点为中度多态(0.25＜PIC＜0.5)。关联分析结果表明,4个SNPs位点不同基因型间乌骨鸡背部皮肤和胸部皮肤L*值均差异不显著(P＞0.05);SNP2位点TT基因型乌骨鸡大腿部皮肤L*值显著低于CC基因型(P＜0.05),SNP4位点CC和CT基因型乌骨鸡大腿部皮肤L*值显著低于TT基因型(P＜0.05),SNP1和SNP3位点不同基因型间乌骨鸡大腿部皮肤L*值无显著差异(P＞0.05)。连锁不平衡分析表明,ALDH7A1基因SNP1和SNP2位点处于强连锁不平衡状态,SNP1-SNP2连锁后产生3种单倍型,其中AATT和CCTT单倍型乌骨鸡大腿部皮肤L*值显著低于CCCC(P＜0.05),但3种单倍型个体间背部皮肤和胸部皮肤L*值均差异不显著(P＞0.05)。【结论】ALDH7A1和EDNRB2基因与丝羽乌骨鸡大腿部皮肤乌色度密切相关,ALDH7A1基因的AATT、CCTT单倍型和EDNRB2基因的TT基因型可作为研究丝羽乌骨鸡大腿部皮肤乌色度的候选分子标记,本研究为下一步利用分子标记辅助育种加快培育乌色度高的丝羽乌骨鸡新品种提供参考。

关键词：乌骨鸡;ALDH7A1基因')">ALDH7A1基因;EDNRB2基因')">EDNRB2基因;乌色度;SNP

基金资助：江苏省自然科学基金青年基金项目(BK20230729);江苏省自然科学基金(BK20211121);江苏省种业振兴揭榜挂帅项目(JBGS[2021]107);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-41);江苏省农业自主创新基金项目(CX(21)2011-1);扬州市现代农业项目(YZ2021029)