基于转录组测序挖掘犊牦牛肾周脂质沉积关键基因

来源：中国畜牧兽医杂志2024年第7期北京时间：

作者：赵宇田, 陈付菊, 伊平昌, 马敏, 王守宁, 全七十六

单位：1. 青海大学农牧学院, 西宁 810016;2. 大通县农业农村局, 大通 810100;3. 甘泉县畜牧兽医服务中心, 延安 716100;4. 西宁市农业综合行政执法监督局, 西宁 810000;5. 大通县养殖推广中心, 大通 810100

摘要：【目的】比较不同日龄犊牦牛肾周脂肪组织转录组表达谱的变化,挖掘调控犊牦牛肾周脂质沉积的信号通路和关键基因。【方法】选取1、7和30日龄各3头健康雄性犊牦牛,放血处死,采集肾周脂肪组织,利用Illumina HiSeq平台进行转录组测序,对转录组数据进行质控、比对、差异表达基因(DEGs)筛选,并对DEGs进行GO功能和KEGG通路富集分析。随机选取7个基因进行实时荧光定量PCR验证。【结果】转录组结果显示,在1和7日龄比较组中共鉴定到1 627个显著DEGs,其中939个上调,688个下调;在7和30日龄比较组中共鉴定到3 979个显著DEGs,其中1 925个上调,2 054个下调。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,在1和7日龄比较组中DEGs富集到酰基辅酶A脱氢酶活性条目,参与了脂肪酸生物合成、胰岛素抵抗、PPAR信号通路及鞘磷脂信号通路等;在7和30日龄比较组中DEGs富集到脂肪酸代谢、脂质代谢、磷酸水解酶活性及脂肪酶活性等多个生物过程,参与了丁酸盐代谢、脂肪酸代谢、甘油磷脂代谢、磷脂酶D信号通路及AMPK信号通路等。从富集通路中发现,SCD、ADIPOQ、PLIN1、ACADM和LPL等基因是与犊牦牛肾周脂质沉积相关的候选基因。实时荧光定量结果显示,7个基因的表达与转录组测序结果一致。【结论】本研究筛选出SCD、ADIPOQ、PLIN1、ACADM和LPL共5个与脂肪细胞分化和脂质沉积相关的基因。研究结果为进一步探究不同生长阶段犊牦牛肾周脂质沉积提供理论依据。

关键词：犊牦牛;肾周脂肪组织;转录组;脂质沉积

基金资助：青海省科技厅应用基础研究项目(2024-ZJ-785)