雷州山羊TBX15基因多态性及其与体尺性状的关联分析

来源：中国畜牧兽医杂志2024年第9期北京时间：

作者：周光现, 谭嘉泳, 杨健, 刘艳芬, 甘尚权, 赵志辉, 康丹菊

单位：广东海洋大学滨海农业学院, 湛江 524088

摘要：【目的】 本研究旨在筛查雷州山羊T盒子转录因子15(TBX15)基因潜在的单核苷酸多态性(SNP)位点，并分析其与体尺性状的关联性，为雷州山羊分子选育提供理论支撑。【方法】 采集78只雷州山羊血样提取基因组DNA，利用PCR扩增和直接测序法检测TBX15基因SNP位点，并分析其遗传多样性；采用SPSS 23.0软件分析TBX15基因多态性与雷州山羊体高、体长和胸围等体尺性状的关联性；利用HaploView软件进行TBX15基因SNP位点的连锁不平衡和单倍型分析。【结果】 在雷州山羊TBX15基因内含子上发现3个SNPs位点：g.96346139 A＞G、g.96345894 T＞C和g.96330058 G＞A，均存在3种基因型，优势基因型分别为GG、CC和AA；卡方检验结果表明，其均处于Hardy-Weinberg平衡状态；多态信息含量(PIC)分别为0.309、0.285及0.294，均为中度多态(0.25＜PIC＜0.50)。关联分析结果发现，雷州山羊TBX15基因g.96346139 A＞G位点GG基因型个体的体高、十字部高和体斜长均显著高于AA基因型(P＜0.05)；g.96345894 T＞C位点CC基因型个体的体高、十字部高、体斜长和胸深均显著高于TT基因型(P＜0.05)；g.96330058 G＞A位点GG基因型个体的胸深显著低于其他2种基因型(P＜0.05)。在单倍型和连锁不平衡分析中发现，3个SNPs位点间存在强连锁关系(R2＞0.33)，有5种主要单倍型，其中优势单倍型是ACG，其概率为0.716。【结论】 雷州山羊TBX15基因3个SNPs位点对体高、体斜长等体尺指标具有显著影响，且该3个位点间具有强连锁关系，单倍型ACG可作为雷州山羊选育的候选标记。

关键词：雷州山羊;TBX15基因')">TBX15基因;体尺性状;多态性;关联性

基金资助：2022年广东省乡村振兴战略专项资金种业振兴项目(2022-XDY-00-009);湛江市科技计划项目-山羊养殖技术服务与推广(A23085);广东省现代农业产业技术体系创新团队项目(2019KJ137);广东海洋大学大学生创新创业训练计划项目(S202210566036);广东海洋大学博士启动基金(R20045、R19066);广东海洋大学2022年度质量工程建设项目-动物科学专业(PX-16223472);雷州山羊保育种技术集成与示范(K20191)