鸽F3卵泡转录组构建及卵泡闭锁相关基因分析

来源：中国畜牧兽医杂志2024年第9期北京时间：

作者：王莹, 陈静, 苗冬枝, 张弛, 陈俊红, 杨海明, 王志跃

单位：1. 扬州大学动物科学与技术学院, 扬州 225009;2. 金陵科技学院动物科学与食品工程学院, 南京 210000

摘要：【目的】 通过对鸽F3卵泡颗粒细胞进行高通量测序筛选出与卵泡闭锁相关的关键基因。【方法】 选择产蛋间隔第5(LI5)和7(LI7)天的白羽王鸽各3只，构建F3卵泡颗粒细胞转录文库，利用转录组测序筛选差异表达基因(differentially expressed genes，DEGs)，并对DEGs进行功能注释，利用实时荧光定量PCR对随机选择的5个DEGs进行表达量验证。【结果】 LI5和LI7期鸽F3卵泡颗粒细胞的6个cDNA文库中获得41.96～43.62 Mb clean reads，Q30＞92%，比对率为82.21%～85.94%。筛选出LI5和LI7期F3卵泡颗粒细胞DEGs共6 587个，其中2 318个基因上调，4 269个基因下调。GO功能富集分析显示，DEGs主要富集在细胞过程、代谢过程、连接和催化活性功能等条目。KEGG通路富集分析显示，DEGs主要显著富集到聚焦黏附、内质网加工蛋白、卵巢类固醇合成和类固醇激素生物合成等信号通路。结合蛋白-蛋白互作网络和关键通路的DGEs发现，StAR、HSD3B1、MARCH6、BCL2、BOK、CDCA7等基因在鸽卵泡闭锁中发挥了重要作用。实时荧光定量PCR结果显示，5个基因在LI5和LI7期鸽F3卵泡颗粒细胞中表达变化趋势与转录组测序结果一致。【结论】 试验获得的6个差异表达基因(StAR、HSD3B1、MARCH6、BCL2、BOK、CDCA7)在鸽卵泡闭锁中发挥重要作用，为进一步了解鸽卵泡闭锁的分子机制提供依据，并为抑制鸽卵泡闭锁、提高鸽产蛋量提供理论基础。

关键词：鸽;产蛋间隔;颗粒细胞;卵泡闭锁;转录组

基金资助：国家自然科学基金(32372875);江苏高校优势学科建设工程四期项目(PAPD)