梅花鹿早期妊娠不同时期血液转录组分析

来源：中国畜牧兽医杂志2024年第9期北京时间：

作者：孙慧敏, 范冰峰, 张旭林, 邵静, 刘理想, 许保增

单位：1. 中国农业科学院特产研究所, 长春 130112;2. 特种经济动物分子生物学国家重点实验室, 长春 130112;3. 中国农业科学院研究生院, 北京 100081

摘要：【目的】 通过分析梅花鹿早期妊娠不同时期的血液转录组数据，筛选参与梅花鹿早期妊娠的关键基因。【方法】 分别采集人工授精后0、7、15和20 d的雌性梅花鹿血液样品，利用Illumina HiSeqTM3000C测序平台进行转录组分析。对不同时期的血液样本进行主成分分析和组间表达相关性分析，鉴定梅花鹿早期妊娠的关键阶段，利用DESeq筛选各时期的差异表达基因(DEGs)，并进行GO和KEGG功能分析以及蛋白互作网络构建。【结果】 转录组测序结果显示，妊娠第15天时梅花鹿血液出现了转录高峰，比较组D7 vs D0、D15 vs D7、D20 vs D15分别筛选到181、996、265个DEGs。其中比较组D7 vs D0共筛选到ERAS、MET、KDR等7个关键基因。综合GO和KEGG功能富集结果显示，基因主要富集在细胞对刺激的响应、信号转导等生物过程，以及PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等通路中；比较组D15 vs D7共筛选到HRAS、HIF1A、MAPK1、JAK1等10个关键基因，主要富集在免疫系统进程、免疫反应、趋化因子信号通路、C型凝集素受体信号通路等信号通路中；比较组D20 vs D15共筛选到MAPK1、MMP2等4个关键基因，主要富集在雌激素信号通路和松弛素信号通路中。【结论】 本研究分析了梅花鹿早期妊娠关键时间点血液转录组的动态表达，筛选到KDR、HRAS、MAPK1、JAK1等关键基因，为梅花鹿早期妊娠诊断标志物的挖掘提供参考。

关键词：梅花鹿;转录组;妊娠标志物;胚胎发育;妊娠识别

基金资助：吉林省实验动物领域创新研究项目(20230505045ZP);吉林省梅花鹿产业技术体系(JARS-2024-0801-05)