2023年成都地区猪圆环病毒3型流行病学调查及遗传进化分析

来源：中国畜牧兽医杂志2024年第10期北京时间：

作者：黄云川, 范磊, 林鑫, 雷玉, 王兴丽, 徐志文, 岳建国

单位：1. 成都市动物疫病预防控制中心, 成都 610041;2. 四川农业大学动物医学院, 成都 611130

摘要：【目的】 调查分析成都地区猪圆环病毒3型(PCV3)的流行与分子遗传进化情况。【方法】 试验于2023年1月至2023年12月从成都地区4家无害化处置场采集病死猪组织样品2 113份，采用实时荧光定量PCR法检测病料组织PCV3感染情况。设计3对引物对阳性样品的PCV3基因组序列进行PCR扩增并测序。通过在线软件拼接PCV3基因组序列、截取ORF2基因序列并推导其氨基酸序列(Cap)，进行相似性比对并构建遗传进化树，分析Cap氨基酸序列突变情况。【结果】 组织病料检测结果显示，2 113份病死猪组织样品的PCV3阳性率为27.21%(575/2 113)。根据PCR扩增测序结果拼接获得了15株PCV3基因组序列。相似性比对分析显示，15株PCV3核苷酸序列相似性为97.2%～100%，ORF2基因核苷酸序列相似性为97.2%～100%，Cap氨基酸序列相似性为96.7%～100%。遗传进化树结果显示，12株PCV3属于PCV3a亚型，3株属于PCV3c亚型。15株Cap氨基酸序列中共13株发生了突变，共存在13个突变位点。【结论】 成都地区PCV3主要为PCV3a和PCV3c亚型，基因组相似性高，序列较保守，Cap氨基酸突变位点主要集中在抗原表位。本试验结果提示该地区需制定科学的防控政策，防止病毒蔓延。

关键词：猪圆环病毒3型(PCV3);流行病学;分子遗传进化

基金资助：四川省“十四五”川猪重大科技专项-川猪重大疫病防控新技术新产品创制(2021ZDZX0010-3)