基于cELISA检测的绵羊抗布鲁氏菌病性状全基因组关联分析

来源：中国畜牧兽医杂志2024年第10期北京时间：

作者：武上杰, 李佳佳, 蒋琳, 马月辉, 丁家波, 何晓红

单位：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193

摘要：【目的】 挖掘与绵羊布鲁氏菌病抗性或易感性相关的基因，以期为绵羊布鲁氏菌病抗病育种提供分子标记。【方法】 以自然感染布鲁氏菌病并且未注射疫苗的绵羊为研究对象，采集50只绵羊的血液样本进行竞争酶联免疫吸附试验(competitive enzyme-linked immunosorbent assay，cELISA)。对绵羊血液DNA进行全基因组重测序，以cELISA结果为数量性状表型，利用GEMMA软件进行全基因组关联分析。使用clusterProfiler软件包对显著基因进行功能富集分析。【结果】 全基因组关联分析筛选到Top 1 000的位点共注释到56个基因，GO功能富集结果显示，注释基因主要富集在β选择和αβ T细胞增殖和分化等条目；KEGG通路富集分析结果显示，注释基因主要富集在Th1/Th2/Th17细胞分化和自然杀伤细胞介导的细胞毒性等通路，主要涉及γ-干扰素受体1(interferon gamma receptor 1，IFNGR1)、活化T细胞核因子2(nuclear factor of activated T cells 2，NFATC2)、NF-κB抑制因子β(NF-κB inhibitor beta，NFKBIB)、脾酪氨酸激酶(spleen associated tyrosine kinase，SYK)、转化生长因子β受体2(transforming growth factor beta receptor 2，TGFBR2)和T细胞受体相关蛋白激酶70的Zeta链(Zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70，ZAP70)共6个基因，筛选到的条目、通路和基因与布鲁氏菌的感染或宿主的抗感染密切相关。【结论】 本研究筛选到6个与绵羊布鲁氏菌病相关的基因，为进一步细胞或个体水平的功能验证奠定了基础，为绵羊布鲁氏菌病抗病育种分子标记提供了参考。

关键词：绵羊;布鲁氏菌病;竞争酶联免疫吸附试验(cELISA);全基因组关联分析(GWAS)

基金资助：科技创新2030重大项目(2023ZD0405104)；国家重点研发计划(2022YFD1300201)；中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS01)