基于16S rDNA测序分析毛滴虫对猕猴肠道菌群结构的影响

来源：中国畜牧兽医杂志2024年第11期北京时间：

作者：李鹤龄, 陈智岗, 宗发梁, 宁卿, 严玉霖, 王宏

单位：1. 昆明理工大学灵长类转化医学研究院, 昆明 650500;2. 云南中科灵长类生物医学重点实验室, 昆明 650217;3. 云南农业大学动物医学院, 昆明 650201

摘要：【目的】 通过16S rDNA测序技术分析毛滴虫感染对猕猴肠道菌群结构的影响，为临床研究利用微生物替代抗生素治疗毛滴虫病提供参考依据。【方法】 分别收集毛滴虫阳性和阴性的猕猴新鲜粪便样本各6份，通过宏基因组测序进行肠道菌群和功能基因预测分析。【结果】 与健康猕猴相比，感染毛滴虫的猕猴肠道菌群的多样性降低，菌群组成发生显著变化，拟杆菌和纤维杆菌显著减少(P＜0.05)，而弯曲菌和脱硫杆菌显著增加(P＜0.05)；肠道微生物中乳酸杆菌目(Lactobacillales)、弯曲杆菌属(Campylobacter)、弯曲杆菌科(Campylobacteraceae)等在感染毛滴虫的猕猴中显著富集，而普雷沃菌9菌(Prevotella_9)、拟杆菌目(Bacteroidales)、拟杆菌门(Bacteroidota)等在健康猕猴中更丰富；Brachyspira_hampsonii、Prevotellaceae_bacterium_Marseille_P2831是猕猴毛滴虫感染的生物标记物；肠道菌群功能基因预测显示，与氨基酸的生物合成和抗生素的生物合成途径相关的微生物基因功能在毛滴虫感染的猕猴中显著降低(P＜0.05)。【结论】 毛滴虫感染猕猴可降低肠道菌群的多样性，改变了肠道微生物群的结构，降低肠道菌群的生物合成功能。

关键词：猕猴;毛滴虫;16SrDNA;肠道菌群;功能基因预测

基金资助：国家自然科学基金(31960121);云南省自然科学基金项目(202001BC070001、202102AA100053)