细粒棘球绦虫PCNA蛋白生物信息学分析及验证

来源：中国畜牧兽医杂志2024年第11期北京时间：

作者：许少全, 麦尔哈巴·麦麦提艾力, 吕国栋, 周润, 赵金龙, 李婧, 夏衣旦木·吐尼牙孜, 赵军

单位：1. 新疆医科大学药学院, 乌鲁木齐 830054;2. 新疆医科大学第一附属医院药学部临床药学科, 乌鲁木齐 830054

摘要：【目的】 分析细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus sensu lato，Eg)增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)蛋白的生物信息学特性，以及去氢骆驼蓬碱(HM)及其衍生物(H-2-168与H-2-104)对EgPCNA蛋白含量的影响，以期治疗囊型棘球蚴病并为药物靶点的筛选奠定基础。【方法】 运用PCR扩增并克隆EgPCNA基因全长序列，采用生物信息学软件预测和分析EgPCNA蛋白相关生物学信息。利用Mega 7.0构建蛋白序列系统发育树，并运用Western blotting分析HM及其衍生物(H-2-168与H-2-104)对EgPCNA蛋白含量的影响。【结果】 EgPCNA基因全长783 bp，编码260个氨基酸，EgPCNA蛋白分子质量为28.36435 ku，等电点为4.62，脂肪指数为96.81，亲水性值为－0.015，为亲水性蛋白，无跨膜结构域。亚细胞定位预测结果显示，蛋白分布于细胞质。该蛋白含有PCNA超家族结构与PCNA保守功能结构域，二级结构主要为无规则卷曲，其次是α-螺旋，有2条可靠的B细胞抗原表位，与人和家鼠等哺乳动物的亲缘关系较远。Western blotting分析结果显示，与DMSO组相比，HM组EgPCNA蛋白表达量极显著上调(P＜0.01)，H-2-168与H-2-104组EgPCNA蛋白表达量均显著下调(P＜0.05)。【结论】 本研究成功克隆了EgPCNA全长基因。EgPCNA蛋白对细粒棘球绦虫的DNA复制和修复具有调控作用，H-2-168与H-2-104具有下调EgPCNA蛋白含量的功能。

关键词：细粒棘球绦虫;增殖细胞核抗原;克隆;生物信息学

基金资助：国家自然科学基金(82160700)