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《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析
作者:李松倍, 谢永生, 龙晓琴, 张晓晓, 陈永杰, 张春红, 焦茂兴, 郭春和
单位:1. 华南农业大学兽医学院, 动物疫病防控全国重点实验室, 广州 510642;2. 宜春学院生命科学与资源环境学院, 宜春 336000;3. 肇庆市动物疫病预防控制中心, 肇庆 526000
摘要:【目的】 了解2023年华南地区猪场猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的遗传变异情况,为华南地区PRRSV的防控提供理论依据。【方法】 采用实时荧光定量PCR方法对华南地区不同猪场采集的328份样品进行PRRSV检测,对来自不同猪场具有代表性的29个PRRSV阳性样品ORF5基因进行测序和遗传进化分析。【结果】 所有样本中PRRSV的阳性率为54.27%(178/328),获得29株PRRSV。ORF5基因序列分析结果显示,所获得的PRRSV 毒株均属于基因Ⅱ型毒株,29株PRRSV ORF5基因之间的核苷酸序列相似性为83.7%~100%,氨基酸序列相似性为83.0%~100%。其中6株属于以重组毒株NADC30-like为代表的谱系1,2株属于以经典毒株VR2332为代表的谱系5,21株属于以高致病性毒株JXA1为代表的谱系8。ORF5基因氨基酸突变主要集中在2个高变区、1个诱饵表位和3个跨膜区。谱系1的5株毒株的诱饵表位区域发生了V27A突变,谱系5的2株毒株的诱饵表位区域发生了V29A突变。在中和表位区域,谱系1的8株毒株发生了I39L突变,谱系8的5株毒株发生了I39F突变。在毒力相关位点中,部分毒株发生了R13Q、R151K、R151I、R151G突变。此外,谱系1的N-糖基化位点变异较多,主要集中在第30-32、32-34、33-35、34-36、35-37、57-59位氨基酸处,而谱系5和谱系8的N-糖基化位点相对保守。【结论】 目前华南地区猪场的PRRSV阳性率仍较高,PRRSV流行以多谱基因Ⅱ型为特征,谱系8和谱系1毒株占比较高,并且变异复杂多样,需加强对PRRSV的监测,以掌握PRRSV毒株之间的遗传变异情况,及时做好防控。
关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV);遗传变异;ORF5基因')">ORF5基因;谱系
基金资助:国家自然科学基金项目(32122082、32072695);广州市科技计划项目(2023B03J0947);岭南现代农业科学与技术广东省实验室自主项目(NG2022003);江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ211626);宜春学院博士科研启动项目(3360122008)