2株水禽源坦布苏病毒的分离鉴定及全基因序列分析

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第1期北京时间：

作者：陈作鑫, 潘彦林, 黄允真, 李林林, 董嘉文, 向勇, 徐志宏, 孙敏华, 黄淑坚, 廖明, 张俊勤

单位：1. 广东省农业科学院动物卫生研究所, 农业农村部禽流感等家禽重大疾病防控重点实验室, 广东省畜禽疫病防治研究重点实验室, 广东省动物疫病野外科学观测研究站, 广州 510640;2. 佛山大学生命科学与工程学院, 佛山 528225;3. 仲恺农业工程学院动物科技学院, 广州 510225

摘要：【目的】 探究水禽源坦布苏病毒(Tembusu virus,TMUV)流行毒株遗传变异情况及其膜前体蛋白(prM)和囊膜蛋白(E)的分子特征。【方法】 利用仓鼠肾细胞(BHK-21)对疑似TMUV感染的鸭、鹅肝脏组织样品进行病毒分离,通过全基因克隆、测序、拼接获得分离株全基因序列。运用ModelFinder、MrBayes软件进行开放阅读框(open reading frame,ORF)、E基因的遗传进化分析;以GenBank数据库中TMUV MM1775株为参考,对分离株prM和E蛋白进行氨基酸突变位点分析;利用生物信息学在线软件对prM、E蛋白的跨膜区域、B细胞抗原表位、二级结构与三级结构进行预测。【结果】 试验分离获得2株水禽源TMUV分离株,分别命名为FSE、ZJ2。全基因组遗传进化分析显示,分离株FSE、ZJ2分别属于Cluster 2.1.1与Cluster 2.2。氨基酸变异位点分析结果显示,FSE、ZJ2株prM和E蛋白中均存在多个氨基酸变异位点。生物信息学分析结果显示,FSE、ZJ2株E蛋白均存在2个跨膜区;prM、E蛋白中均存在多个线性B细胞抗原表位,与疫苗株DF-2的prM、E蛋白抗原表位氨基酸序列相比,FSE株prM蛋白存在E73H氨基酸位点突变,E蛋白存在A157V氨基酸位点突变;二级结构均以无规则卷曲为主,三级结构预测结果与二级结构相一致。【结论】 本研究从广东地区分离得到2株Cluster 2 TMUV,2株分离株prM、E蛋白均存在多个氨基酸突变位点,表明TMUV在广东地区的流行过程中仍在不断发生变异。

关键词：坦布苏病毒;病毒分离;遗传进化;生物信息学

基金资助：国家自然科学基金(32102691);广州市科技计划项目(2024A04J6754);广东省畜禽疫病防治研究重点实验室项目(2023B1212060040);广东省动物疫病野外科学观测研究站项目(2021B1212050021)