PLPP3基因多态性对北京黑猪背部脂肪厚度和脂肪酸含量的影响

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第1期北京时间：

作者：祝雪丽, 马嘉宁, 许可, 孙超, 刘欣, 蒲蕾

单位：1. 天津农学院动物科学与动物医学学院, 天津市农业动物繁育与健康养殖重点实验室, 天津 300392;2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193;3. 天津现代天骄农业科技股份有限公司, 天津市绿色生态饲料重点实验室, 天津 301800

摘要：【目的】 探究磷脂磷酸酶3(PLPP3)基因多态位点与北京黑猪背部脂肪厚度及其脂肪酸含量的相关性,为北京黑猪背部脂肪厚度和脂肪酸含量的遗传改良提供参考。【方法】 本研究采集239头北京黑猪耳组织样,获得基因组重测序数据。测定北京黑猪不同部位(肩部最厚处、第6和第7胸椎结合处、胸腰结合处、腰荐结合处)的背部脂肪厚度及左侧胴体第6和7胸椎背部脂肪中5种脂肪酸(棕榈酸、硬脂酸、油酸、亚油酸、α-亚麻酸)的含量。利用测序结果研究PLPP3基因的单核苷酸多态性(SNP)位点的群体遗传特性、单倍型连锁情况,将SNP位点与各部位背部脂肪厚度及脂肪酸含量进行关联分析。进行启动子区SNP转录因子(transcription factor,TF)预测,并运用实时荧光定量PCR技术检测PLPP3功能位点不同基因型个体背部脂肪中基因的表达差异。【结果】 该北京黑猪群体中PLPP3基因包含8个SNPs,共5个SNPs显示中度多态性(0.25＜PIC＜0.5),3个SNPs为低度多态性(PIC＜0.25),g.155894136 C＞T位点呈现哈代-温伯格平衡状态(P＞0.05)。单倍型连锁分析显示,g.155800228 G＞A和g.155800259 A＞C位点之间存在较强的连锁(D’=91%);g.155891807 G＞A和g.155891715 A＞G位点之间存在一定的连锁性(D’＞80%)。基因多态位点与背部脂肪厚度性状的关联分析结果表明,g.155800222 C＞A、g.155891715 A＞G、g.155891807 G＞A、g.155894136 C＞T位点不同基因型个体的背部脂肪厚度存在显著差异(P＜0.05)。基因多态位点与脂肪酸含量的关联分析显示,g.155800222 C＞A、g.155800228 G＞A位点不同基因型个体背部脂肪中的棕榈酸含量和亚油酸/α-亚麻酸存在显著差异(P＜0.05)。启动子区SNPs TF预测发现,g.155800228 G＞A位点的变异,导致与其结合的TF由SPI1变为MYB。进一步分析g.155800228 G＞A位点不同基因型个体背部脂肪组织PLPP3基因的表达情况,发现AA基因型个体PLPP3基因mRNA水平显著高于GG基因型(P＜0.05)。【结论】 PLPP3基因的多态位点不同基因型个体的北京黑猪不同部位背部脂肪厚度及部分脂肪酸含量存在显著差异。这些多态位点可作为北京黑猪背部脂肪厚度和脂肪酸含量的潜在分子标记,为北京黑猪的选育提供理论支撑。

关键词：北京黑猪;PLPP3基因')">PLPP3基因;背部脂肪厚度;脂肪酸

基金资助：国家重点研发计划(2021YFD1301101);国家自然科学基金(32202650);国家生猪产业技术体系(CARS-35);天津市科技计划项目(23ZYCGSN00230);大学生创新创业计划项目(202310061006);天津市生猪产业技术体系(ITTPRS2024006);天津市绿色生态饲料重点实验室(TJ202302)