利用微卫星标记分析山西3个地方牛群体的遗传多样性和遗传分化

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第1期北京时间：

作者：李超杰, 蒙萌, 李博, 靳光, 王坤, 车雷杰, 乔晓春, 张元庆, 牛晓艳

单位：1. 山西农业大学动物科学学院, 太谷 030801;2. 运城市国家级晋南牛遗传资源保护中心, 运城 044000;3. 平遥上五勤兴健养殖合作社, 平遥 031100

摘要：【目的】 研究晋南牛、平陆山地牛和"太行云牛"3个群体的遗传多样性、遗传结构和遗传分化情况,为山西地方牛品种保护提供数据支持。【方法】 采用12个微卫星标记对3个群体共230个个体进行PCR扩增、测序和分型,并对各群体的等位基因数、遗传杂合度、多态信息含量以及群体间的遗传距离等参数进行评估。【结果】 12个微卫星标记中等位基因数为2~15个。3个群体的有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量的平均值分别为3.205~4.611、0.680~0.735、0.646~0.750和0.601~0.716。Hardy-Weinberg平衡(HWE)检测结果显示,除晋南牛在HAUT27座位上显著偏离HWE外(P＜0.05),其余标记均未偏离HWE(P＞0.05)。F统计量结果显示,群体内近交系数(FIS)为―0.012,群体平均近交系数(FIT)为0.043,群体分化系数(FST)为0.054。UPGMA系统发育树结果表明,平陆山地牛和晋南牛聚为一支,"太行云牛"则单独为一支。主坐标分析(PCoA)结果显示,晋南牛和平陆山地牛两个群体间存在较近的亲缘关系,且不同群体间存在一定的遗传交流。STRUCTURE结果进一步发现,3个群体间存在一定的群体混杂现象。【结论】 山西3个地方牛群体内遗传多样性水平较高,各种群的系统发育关系相对独立,且晋南牛与平陆山地牛之间存在较多的基因交流。本研究结果有助于深入理解山西地方牛群体的遗传结构,并对品种保护方案的制订提供了重要的数据基础。

关键词：地方牛群体;微卫星;遗传多样性;遗传分化;遗传结构

基金资助：山西省重点研发计划项目(201903D211012);山西省种业创新良种联合攻关项目(YZGG-07)