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《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析

梅花鹿CSRP3基因克隆、生物信息学分析及其在肌肉组织中的表达分析

来源:中国畜牧兽医杂志2025年第2期北京时间:

作者:王晴, 马瑜锴, 韩若冰, 邢海华, 孙子惠, 李和平

单位:东北林业大学野生动物与自然保护地学院, 哈尔滨 150040

摘要:【目的】 探究梅花鹿富含半胱氨酸和甘氨酸蛋白3(cysteine and glycine-rich protein 3,CSRP3)基因的生物学作用及其在不同肌肉组织中的表达情况。【方法】 以梅花鹿背最长肌为试验材料,克隆获得CSRP3基因,测序后进行相似性比对,构建系统进化树,并对CSRP3蛋白进行生物信息学分析。运用实时荧光定量PCR技术来研究梅花鹿背最长肌、臀大肌、股四头肌、肋间肌中CSRP3基因的表达差异。【结果】 成功克隆出梅花鹿CSRP3基因,其编码区片段大小为585 bp,共编码194个氨基酸。BLAST比对结果显示,梅花鹿CSRP3基因与马鹿的相似性最高,为99.83%,与白尾鹿、牛、羊的相似性均超过95%,说明梅花鹿CSRP3基因在进化中具有高度保守性;根据梅花鹿CSRP3基因构建系统进化树,结果表明,梅花鹿与马鹿的亲缘关系最近,与虎和虎鲸的亲缘关系最远。CSRP3基因编码蛋白分子式为C903H1403N263O275S19,相对分子质量为20 952.81,理论等电点(pI)为8.89,脂肪系数为43.81,其二级结构以不规则卷曲为主;亚细胞定位于细胞核内。实时荧光定量PCR结果表明,CSRP3基因在梅花鹿不同部位肌肉组织中均有表达,在梅花鹿肋间肌中的表达量最高,与背最长肌、臀大肌、股四头肌存在显著性差异(P<0.05),而背最长肌、臀大肌和股四头肌之间CSRP3基因表达量差异并不显著(P>0.05)。【结论】 本研究成功克隆了梅花鹿CSRP3基因,其编码蛋白位于细胞核内; CSRP3基因在梅花鹿不同肌肉组织中存在差异表达。本研究结果为CSRP3基因在梅花鹿肉品质方面的调控机制研究提供了数据基础。

关键词:梅花鹿;CSRP3基因')">CSRP3基因;克隆;肌肉;表达

基金资助:黑龙江省学科协同创新成果建设项目(LJGXCG2022-008)

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