不同生长阶段滩羊背最长肌转录组比较

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第3期北京时间：

作者：杜佳文, 任文义, 徐晓锋, 张力莉

单位：宁夏大学动物科技学院, 银川 750021

摘要：【目的】本研究旨在挖掘影响不同生长阶段滩羊背最长肌脂肪沉积的差异基因。【方法】分别采集3、6、9月龄滩羊的背最长肌，提取RNA后构建文库。采用Illumian软件对数据进行过滤、质控、比对，使用HTSeq统计后以Padj(校正后的P值)＜0.05和|log2FoldChange|＞1作为标准筛选差异表达基因，并对基因进行GO功能和KEGG通路富集分析，随机选取5个基因进行实时荧光定量PCR验证。【结果】与3月龄相比，6月龄筛选到129个差异表达基因(上调47个，下调82个)；9月龄筛选到521个差异表达基因(上调119个，下调402个)；与6月龄相比，9月龄筛选到207个差异表达基因(上调45个，下调162个)。GO功能富集结果显示，与3月龄相比，6月龄差异表达基因富集到花生四烯酸单加氧酶活性、磷酸甘油酸脱氢酶活性等过程；9月龄差异表达基因富集到胞质钙离子的正调控、多细胞生物发育的调控等过程；与6月龄相比，9月龄差异表达基因富集到细胞内钙介导的信号传导、脂质磷酸酶活性等过程。KEGG通路注释结果显示，与3月龄相比，6月龄差异表达基因主要富集在胆固醇代谢、氨基糖和核苷酸糖的代谢等信号通路；9月龄差异表达基因主要富集在细胞外基质受体相互作用、胰岛素抵抗等信号通路；与6月龄相比，9月龄差异表达基因主要富集在c-AMP信号通路、生长激素的合成、分泌和作用等信号通路。FGF10、ADCY7等5个基因的实时荧光定量PCR验证结果与转录组测序结果一致。【结论】通过对不同月龄滩羊的背最长肌进行转录组测序分析，筛选出FGF10、STAR可作为3、6月龄滩羊背最长肌脂肪沉积调控的候选基因，ADCY7、CNR1作为6、9月龄滩羊背最长肌脂肪沉积调控的候选基因，PPARGC1A、SLC2A4作为3、9月龄滩羊背最长肌脂肪沉积调控的候选基因。研究结果可为进一步探究不同生长阶段滩羊背最长肌脂肪沉积提供理论依据。

关键词：滩羊;转录组;脂肪;背最长肌

基金资助：国家自然科学基金(32160797)