织金白鹅PPP3CA基因多态性及其与体尺性状的关联分析

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第4期北京时间：

作者：赵中龙, 张勇, 杨红, 杨润黔, 艾照碧, 叶丽, 舒畅

单位：1. 贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种 与繁殖重点实验室, 贵阳 550025;2. 毕节市畜牧站, 毕节 551700

摘要：【目的】鉴定织金白鹅蛋白磷酸酶3催化亚基α(PPP3CA)的单核苷酸多态性(SNPs)位点，并探究PPP3CA基因多态性对体尺性状的影响。【方法】以织金白鹅为试验对象，通过PCR扩增和Sanger直接测序法鉴定144羽织金白鹅PPP3CA基因SNPs位点，利用Excel 2010软件对基因频率、基因型频率、有效等位基因数(Ne)、多态信息含量(PIC)进行计算，分析Hardy-Weinberg平衡状态，利用SPSS 25.0软件一般线性模型(GLM)中单因素方差分析144羽织金白鹅体尺性状指标与SNPs位点间的关联性。【结果】在织金白鹅PPP3CA基因内含子2、4区域处共发现9个SNPs位点，分别为g.58398 A＞G、g.58504 A＞G、g.58541 A＞G、g.68997 A＞G、g.69001 C＞T、g.69034 C＞T、g.69052 T＞C、g.69070 T＞C和g.69114 C＞T。其中，除g.69034 C＞T为低度多态性位点外(PIC＜0.25)，其余位点均为中度多态性位点(0.25＜PIC＜0.5)。χ2检验结果表明，位点g.58398 A＞G、g.69001 C＞T、g.69070 T＞C和g.69114 C＞T符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05)，而位点g.58504 A＞G、g.58541 A＞G、g.68997 A＞G、g.69034 C＞T和g.69052 T＞C均偏离Hardy-Weinberg平衡(P＜0.05)。关联分析结果发现，在g.58504 A＞G和g.58541 A＞G位点中，GG基因型个体的髋骨宽极显著或显著高于AA基因型(P＜0.01；P＜0.05)。【结论】织金白鹅PPP3CA基因共存在9个SNPs位点，其中g.58504 A＞G与g.58541 A＞G位点不同基因型与髋骨宽存在不同程度相关，表明以上位点可作为织金白鹅分子标记辅助选育参考位点，为深入研究鹅PPP3CA基因奠定理论基础。

关键词：织金白鹅;PPP3CA基因')">PPP3CA基因;SNPs;体尺性状;关联分析

基金资助：贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2021]一般156)