合作猪TRIF基因CDS区克隆鉴定及组织表达分析

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第4期北京时间：

作者：胡慧慧, 付盼盼, 李杰, 闫尊强, 高小莉, 杨姣姣, 黄晓宇

单位：1. 甘肃农业大学动物科学技术学院, 兰州 730070;2. 甘肃省现代养猪工程技术研究中心, 兰州 730070

摘要：【目的】β-干扰素TIR结构域衔接蛋白(TIR domain-containing adaptor protein inducing interferon β,TRIF)基因在机体抗病免疫中具有重要作用，本研究旨在探究合作猪TRIF基因CDS区序列特征及组织表达特点。【方法】以甘肃合作猪为研究对象，克隆TRIF基因CDS区全长序列，并对其进行生物信息学分析，采用实时荧光定量PCR技术检测合作猪TRIF基因在肺脏、肾脏、脾脏、背最长肌、盲肠、回肠、直肠、结肠共8种组织中的表达量。【结果】合作猪TRIF基因CDS区全长2 142 bp，编码713个氨基酸，与NCBI数据库中收录的野猪TRIF基因序列(登录号：NM_001315738.2)相似性为99.81%。系统进化树结果显示，合作猪与野猪亲缘关系最近，与斑马鱼亲缘关系最远。合作猪TRIF蛋白具有亲水性，无跨膜区域，不存在信号肽，且不存在N-糖基化修饰位点，其主要定位于细胞核内。TRIF蛋白的二级结构主要以无规则卷曲为主，三级结构与二级结构预测结果基本一致，该蛋白存在6个低复杂度结构域和1个卷绕线圈区域。实时荧光定量PCR检测结果表明，合作猪TRIF基因在肺脏、肾脏、脾脏、背最长肌、盲肠、回肠、直肠、结肠中均有表达，其中在背最长肌中表达量最高。【结论】本试验成功克隆出合作猪TRIF基因CDS区序列，其在背最长肌中的表达量最高，该研究结果可为后续研究合作猪TRIF基因提供参考依据。

关键词：合作猪;TRIF基因')">TRIF基因;生物信息学;表达

基金资助：国家自然科学基金资助项目(32360819);甘肃地方猪种质资源保护及品质提升(GSLK-2021-13);甘肃农业大学畜牧学养猪产业技术创新团队(GAU-XKTD-2022-25)