杜洛克猪×二花脸猪F2代杂交猪免疫性状全基因组关联分析

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第4期北京时间：

作者：苗娜, 乔嘉坤, 杨慧, 韩萍萍, 许方军, 车兆轩, 代翔毓, 徐明航, 龙志伟, 朱猛进

单位：1. 华中农业大学, 农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 武汉 430070;2. 华中农业大学, 生猪健康养殖协同创新中心, 武汉 430070

摘要：【目的】猪是重要的农业动物，其免疫性状的解析对于提高生产效率和抗病能力至关重要。本研究旨在鉴别与杜洛克猪×二花脸猪F2代杂交猪免疫性状相关的候选基因，为猪抗病育种提供重要的候选基因信息。【方法】采集294头杜洛克猪×二花脸猪F2代杂交猪出生后24 h内的耳、尾组织样本，提取基因组DNA，并在35日龄时采集血液样本用于细胞因子检测。通过对杜洛克猪×二花脸猪F2代杂交猪资源群体的细胞因子(IFN-α、IFN-γ、IGG、IL8、IL10)相关免疫性状进行全基因组关联分析(GWAS)，识别与性状相关的单核苷酸多态性(SNP)位点，使用IFN-γ/IL10值(IFNGIL10)进一步鉴定影响猪免疫性状的相关SNP位点与候选基因，对鉴定的相关基因进行GO功能与KEGG通路富集分析，并对候选基因编码蛋白进行蛋白互作(PPI)分析。【结果】GWAS共鉴定出10个SNPs，这些SNPs定位到21个与免疫性状相关的候选基因：CH25H、LIPA、SIGMAR1、PIP5KIC、PLCZ1、PIK3C2G、CNTFR、IL11RA、SAP30、HMGB2、CCL21、CCL19、CCL27、GNA11、GNA15、DSCC1、TERF2IP、FZR1、ENPP2、CACTIN和FAS。GO功能富集结果显示，候选基因显著富集在趋化因子活性、细胞对白细胞介素-1的反应和炎症反应等条目。KEGG通路富集结果显示，候选基因显著富集在细胞因子与受体结合通路、肌醇磷酸代谢、钙信号通路等通路。PPI分析共构建了12个子网络，表明这些候选基因之间存在潜在联系，在同一通路上进行显著富集，并共同参与生物过程以发挥其生物功能。【结论】本研究共发现10个与猪免疫性状关联的SNPs位点，结合富集分析与PPI网络筛选到21个目标性状候选基因。本研究结果不仅加深了对猪免疫特性分子基础的理解，也为猪的抗病育种提供了理论依据。

关键词：猪;细胞因子;免疫性状;全基因组关联分析;候选基因

基金资助：国家自然科学基金(31961143020);国家重点研发计划(2021YFD1301201);国家生猪产业技术体系项目(CARS-35)