《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析

1株贝莱斯芽孢杆菌G02全基因组测序分析

来源:中国畜牧兽医杂志2025年第5期北京时间:

作者:余梦博, 马浩天, 李杨, 潘瑞雪, 龙赟而, 赵一宁, 马驿, 周淑贞

单位:1. 广东海洋大学滨海农业学院, 湛江 524088;2. 佛山市南海东方澳龙制药有限公司, 佛山 528234

摘要:【目的】对贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)G02进行全基因组序列分析,挖掘其抑菌和抗菌特性相关基因,以期详细解析其基因组信息。【方法】采用二代测序技术,通过Illumina NovaSeq 6000平台对贝莱斯芽孢杆菌G02进行全基因测序,通过基因组装、基因组全长、功能注释及次级代谢产物预测分析其基因组特征。【结果】全基因组测序结果显示,贝莱斯芽孢杆菌G02基因组全长为3 891 653 bp,共有3 749个蛋白质编码基因,GC含量为46%;基因组序列由12个contigs组成,存在92个非编码RNA,包括8个5S rRNA、2个16S rRNA、1个23S rRNA、80个tRNA和1个tmRNA。功能注释结果显示,GO数据库中注释到9个与抗氧化活性相关的基因;KEGG数据库注释到31条通路,其中参与细菌素合成和免疫相关通路的基因有ko00253、ko00261、ko00521等。通过antiSMASH在线软件预测,共注释到12个次级代谢产物合成基因簇。【结论】贝莱斯芽孢杆菌G02是潜在的产抑菌活性物质的菌株,研究结果为探究贝莱斯芽孢杆菌G02的抑菌机理提供了基础。

关键词:芽孢杆菌;全基因组测序;次级代谢产物;功能注释

基金资助:广东省自然科学基金项目(2023A1515012181)

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