鸭ARHGDIB基因克隆、生物信息学及组织表达研究

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第7期北京时间：

作者：郑好, 刘梦云, 王明玉, 董霞, 史良玉, 余博, 杨宇, 周傲, 陈星

单位：1. 武汉轻工大学动物科学与营养工程学院, 动物遗传繁育与精准养殖实验室, 武汉 430023;2. 武汉市农业科学院畜牧兽医研究所, 武汉 430208

摘要：【目的】 旨在研究鸭Rho GDP解离抑制因子β(ARHGDIB)基因功能，进一步解析鸭皮下脂肪沉积的机理。【方法】 以28日龄武禽10肉鸭肝脏组织cDNA为模板克隆ARHGDIB基因，经琼脂糖凝胶电泳及测序验证正确后，利用在线软件对所获序列进行比对及生物信息学分析，利用实时荧光定量 PCR检测ARHGDIB基因在鸭胸腺、肺脏、脾脏、心脏、十二指肠、肝脏、肾脏、腹脂、胸肌、腿肌、皮脂中的相对表达量。【结果】 鸭ARHGDIB基因全长1 409 bp，预测其编码区长693 bp，包含7个外显子，可编码230个氨基酸，其中亮氨酸含量最高，占比为10%。鸭ARHGDIB基因核苷酸序列与鹅、牛、犬、山羊、斑马鱼、马、家猫、鸡、人、猕猴、家鼠、绵羊、黑猩猩、狒狒、野猪、野鸽的相似性分别为82.56%、50.53%、58.75%、54.08%、24.94%、56.30%、35.31%、81.79%、54.10%、54.90%、49.44%、47.25%、56.22%、55.99%、55.17%和82.64%。系统进化树分析表明，鸭与鹅的亲缘关系最近，其次为野鸽。鸭ARHGDIB蛋白属于稳定的亲水性蛋白，无跨膜结构，有24个磷酸化位点、2个N-糖基化位点，亚细胞定位预测蛋白主要定位在线粒体。鸭ARHGDIB蛋白二级结构由α-螺旋、延长链、β-转角和无规则卷曲4种类型组成，占比分别为25.22%、23.91%、4.35%和46.52%。三级结构与二级结构预测结果一致。实时荧光定量PCR结果显示，ARHGDIB基因在鸭各组织中均有表达，其中在胸腺中的表达量最高，且显著高于其他组织(P＜0.05)；其次是脾脏、心脏、肺脏；在皮脂中的表达量最低，且显著低于其他组织(P＜0.05)。【结论】 鸭ARHGDIB基因编码区长693 bp，编码230个氨基酸，为亲水性蛋白，主要定位于线粒体。ARHGDIB基因在鸭各组织中均有表达，且在胸腺中表达量最高，皮脂中表达量最低。该研究为进一步探索鸭ARHGDIB基因的功能提供了理论依据，为解析其在脂肪代谢中的调节作用和鸭定向育种奠定基础。

关键词：鸭;ARHGDIB基因')">ARHGDIB基因;克隆;生物信息学分析;组织表达

基金资助：湖北省支持种业高质量发展项目(HBZY2023B007)；湖北省自然科学基金面上项目(2023AFB1078)；武汉市科技特派员产学研专项项目(2023110201030688)；武汉市农科院重大创新专项项目(ZDCX202402)