《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析
作者:文英会, 李豪, 陈曦艋, 王坤丽, 赵丽, 马世杰, 闫志浩, 陈红英
单位:1. 河南牧业经济学院动物医药学院, 郑州 450046;2. 河南农业大学动物医学院, 郑州 450002;3. 河南省西峡县农业农村局, 西峡 474500
摘要:【目的】 猪圆环病毒4型(Porcine circovirus type 4,PCV4)是近年来新发现的与猪呼吸道疾病、腹泻及皮炎肾病综合征相关的一种猪圆环病毒。本研究旨在调查河南省猪场中PCV4的流行态势与遗传变异情况。【方法】 对2020年1月至2023年8月从河南省采集的504份疑似PCV4感染的猪血清和组织样品,采用PCR方法进行PCV4检测,对PCV4阳性样品进行全基因组扩增并测序。使用DNAStar软件中MegAlign程序对PCV4全基因组序列进行相似性比对,通过MegAlign和BioEdit软件对Rep、Cap蛋白氨基酸序列进行比对分析。【结果】 504份样品中PCV4检出率为15.28%(77/504),除了信阳地区未检出PCV4外,其他地区均检出PCV4。获得了15条PCV4全基因组序列,它们之间的核苷酸序列相似性为97.7%~99.9%,与GenBank收录的51条PCV4基因组序列相似性为97.7%~100%。氨基酸序列分析显示,Rep蛋白主要氨基酸突变为V239L,Cap蛋白主要氨基酸突变为S27N、R28G和L212M。遗传进化分析显示,PCV4归为圆环病毒科圆环病毒属,与水貂圆环病毒亲缘性最高。15株PCV4中有10株属于PCV4a,3株属于PCV4b,2株属于PCV4c。【结论】 PCV4在河南省猪场中已广泛存在,且PCV4a已成为河南地区主要流行毒株。试验结果丰富了河南地区PCV4的流行病学数据,为PCV4的防控和进一步研究提供参考。
关键词:猪圆环病毒4型(PCV4);分子检测;全基因组;遗传进化
基金资助:河南省高校科技创新人才支持计划(21HASTIT039);河南农业大学拔尖人才项目(30501277)