2020—2024年广西H3N2亚型禽流感病毒HA和NA基因分子特征分析

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第9期北京时间：

作者：尹彦文, 熊陈勇, 韦伟, 施开创, 郑敏, 崔鹏飞, 韦显凯, 李致远, 刘惠心, 冯淑萍, 卢春花, 屈素洁, 陆文俊, 李雪珍, 王睿敏, 邓国华, 欧长波

单位：1. 广西动物疫病预防控制中心, 南宁 530001;2. 广西农垦永新畜牧集团龙北牧业有限公司, 崇左 532400;3. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所, 兽医生物技术国家重点实验室, 农业农村部动物流感重点实验室, 哈尔滨 150069;4. 广西大学动物科学技术学院, 南宁 530005;5. 百色市动物疫病预防控制中心, 百色 533000;6. 广西水牛研究所, 南宁 530001

摘要：【目的】 探究H3N2亚型禽流感病毒(AIV)广西毒株分子遗传进化特征。【方法】 采集2020—2024年广西各地的家禽咽拭子和肛拭子病料，采用实时荧光定量RT-PCR方法鉴别检测H3N2亚型AIV，选取部分阳性样本经尿囊腔接种SPF鸡胚，收集鸡胚尿囊液，提取核酸后通过PCR扩增血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因并测序，进行序列相似性、系统发育、氨基酸变异位点及遗传进化速率分析。【结果】 共获得43株HA和NA基因序列，编码区大小为1 701和1 410 bp。相似性比对分析显示，本研究获得的HA和NA基因之间核苷酸序列相似性分别为86.0%～99.9%和89.7%～99.9%，与GenBank中禽源、人源、猪源和犬源核苷酸序列相似性分别为78.4%～99.7%和78.1%～99.1%。广西H3N2亚型AIV毒株HA和NA基因属于欧亚谱系，与禽源亲缘关系最近，与人源/猪源最远。HA蛋白在第18—20、22—24、38—40、54—56、61—63、181—183、301—303和499—501位氨基酸处出现糖基化，NA蛋白在第61—63、69—71、86—88、143—145、146—148、200—202、234—236、313—315和402—404位氨基酸处出现糖基化，部分氨基酸位点发生变异；HA蛋白裂解位点为340PEKQTR↓GLF348和340PERQTR↓GLF348。遗传进化速率估算结果显示，HA和NA基因遗传进化速率分别为3.26×10-3和3.67×10-3 替换/(位点·年)，HA基因种群规模在不同时间段表现出不同的动态进化特征。【结论】 H3N2亚型AIV广西流行毒株与同种流行毒株亲缘性较近，部分HA和NA蛋白发生特有氨基酸突变，不同种属毒株进化趋势不一致，具有遗传多样性特征。试验结果为防控H3N2亚型AIV提供基础数据。

关键词：禽流感病毒;H3N2亚型;遗传进化;相似性

基金资助：广西科技重大专项(桂科AA23062050)；国家现代农业产业体系广西家禽产业创新团队(nycytxgxcxtd-2024-19)