关岭黄牛GH1基因多态性及其与生长性状的关联分析和GH1蛋白功能预测

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第9期北京时间：

作者：张海娟, 赵永, 杨红文, 吴燕, 向进, 付红梅, 丁义杰, 张依裕

单位：1. 贵州大学动物科学学院, 高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室, 贵州大学香猪研究所, 贵阳 550025;2. 贵州省畜禽遗传资源管理站, 贵阳 550001

摘要：【目的】 生长激素1(growth hormone 1, GH1)是一种合成代谢激素，属于生长激素/催乳素蛋白家族，对于动物的生长发育具有极其重要的作用。试验旨在筛选关岭黄牛GH1基因单核苷酸多态性(SNP)位点，并与生长性状进行关联分析，为开展关岭黄牛的分子育种提供科学依据。【方法】 根据NCBI数据库中牛GH1基因序列(登录号：NC_037346.1)，采用Primer Premier 3.0软件设计3对引物，PCR扩增关岭黄牛GH1基因，利用双向直接测序和序列比对挖掘SNP位点；利用HaploView软件对SNP位点进行连锁不平衡(LD)分析，并识别相关单倍型以探索基因间的相互作用和遗传结构。利用SPSS 21.0软件分析GH1基因与关岭黄牛生长性状的相关性，并对GH1蛋白进行功能预测。【结果】 在关岭黄牛GH1基因外显子5上发现3个SNPs位点：g.44119526 C＞G、g.44119662 C＞T和g.44119676 C＞A。其中，g.44119526 C＞G和g.44119676 C＞A位点属于中度多态，g.44119662 C＞T位点属于低度多态；g.44119662 C＞T和g.44119676 C＞A位点分布符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05)，g.44119526 C＞G位点极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P＜0.01)。3个SNPs共组成4种单倍型(H1、H2、H3、H4)和5种双倍型(H1H1、H1H2、H1H3、H1H4、H2H3)。关联分析结果显示，关岭黄牛GH1基因g.44119676 C＞A位点CC基因型个体腰长显著高于AA基因型(P＜0.05)，双倍型H1H1(CCCCCC)个体腰长显著高于H2H3(GCCCAA)(P＜0.05)。蛋白功能预测结果显示，GH1基因编码217个氨基酸，为稳定蛋白；其二级结构、三级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主。【结论】 关岭黄牛GH1基因5外显子上的g.44119676 C＞A位点突变对于腰长具有显著影响，双倍型H1H1可作为改善关岭黄牛生长性状的遗传标记。

关键词：关岭黄牛;GH1基因')">GH1基因;生长性状;单核苷酸多态性;蛋白功能

基金资助：贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑[2019]2360号)