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《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析
作者:杨蓉, 周迪, 王珍梅, 田兴舟, 陈祥, 吕艳丽, 吴雨, 敖叶, 郭振刚, 赵德鹏, 黄清赟, 张悻
单位:1. 贵州省种畜禽种质测定中心, 贵阳 550018;2. 贵州大学, 高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点试验室, 贵州省动物遗传育种与繁殖重点试验室, 贵阳 550025;3. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025
摘要:【目的】分析贵州黑山羊抗缪勒氏管激素(AMH)、芳香化酶P450(CYP19A1)基因多态性,筛选出对山羊产羔数有显著影响的单核苷酸多态性(SNP)位点。【方法】以贵州黑山羊为研究对象,利用PCR产物直接测序,对AMH、CYP19A1基因全部外显子进SNP位点筛选,运用在线软件预测AMH、CYP19A1蛋白的二级结构、三级结构以及信号肽,并进行SNP位点与产羔数的关联分析。【结果】在贵州黑山羊AMH基因第5外显子处发现1个SNP位点:g.2612 A>G;在CYP19A1基因第5外显子处发现1个SNP位点:g.37836 T>C;在CYP19A1基因第10外显子处发现2个SNPs位点:g.48986 C>T和g.49046 A>G。二级结构、三级结构预测发现,AMH、CYP19A1蛋白突变后二级结构稳定性降低,其中无规则卷曲占比最高,具有更高的复杂性,且AMH、CYP19A1蛋白不存在信号肽。χ2检验结果显示,4个SNPs位点基因座均偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),均属于中度多态(0.25<PIC<0.5)。关联分析结果表明,AMH基因g.2612 A>G位点GG基因型贵州黑山羊产羔数极显著或显著高于AG和AA基因型(P<0.01;P<0.05);CYP19A1基因g.49046 A>G位点GG基因型贵州黑山羊产羔数显著高于AA和AG基因型(P<0.05);其他2个SNPs位点不同基因型间产羔数无显著差异(P>0.05)。【结论】AMH、CYP19A1基因g.2612 A>G、g.49046 A>G位点与贵州黑山羊产羔数具有显著相关,可作为山羊产羔性状的分子标记。试验结果为研究贵州黑山羊多胎性状提供了理论依据。
关键词:贵州黑山羊;AMH基因')">AMH基因;CYP19A1基因')">CYP19A1基因;多态性;产羔数
基金资助:贵州肉用地方山羊新品系培育及良繁示范(黔科合支撑[2022]重点033);地方山羊优势特色性状基因挖掘及验证(黔农财[2024]号)