上海地区鸽Ⅰ型副黏病毒流行株HN基因遗传进化和生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第11期北京时间：

作者：刘健, 周锦萍, 徐卫兵, 白艺兰, 杨显超, 桂亚萍, 夏琦琦, 徐锋, 沈莉萍, 刘佩红, 王建

单位：1. 上海市动物疫病预防控制中心, 上海 201103;2. 上海市浦东新区大团镇经济发展服务中心, 上海 201311;3. 上海市浦东新区畜牧水产技术推广中心, 上海 201299;4. 上海市农业科学院, 上海 201106

摘要：【目的】了解上海地区鸽Ⅰ型副黏病毒(PPMV-1)流行株HN基因遗传进化情况，探讨PPMV-1免疫失败的原因，为研发PPMV-1新型疫苗和抗病毒药物提供技术支持。【方法】采集临床送检疑似PPMV-1感染鸽样品(脑、气管、肺脏、肝脏、胰腺和脾脏)，应用RT-PCR方法进行PPMV-1鉴定，阳性样品进行HN基因测序和遗传进化分析，并通过生物信息学在线软件对HN蛋白结构功能进行分析。【结果】送检鸽鉴定为PPMV-1阳性，其HN基因全长为2 002 bp，编码区全长1 716 bp，编码571个氨基酸，与PPMV-1国内分离株Pi/SH/CH/0617/2013核苷酸相似性最高，为99.8%，与新城疫(NDV)疫苗株La Sota和Mukteswar核苷酸相似性分别只有83.6%和85.5%。遗传进化分析显示，流行株属于NDV Class Ⅱ群Ⅵ.2.1.1.2.2亚型，与NDV国内分离株Pi/SH/CH/0617/2013和pigeon/Ningxia/2068/2016同处一个分支，与La Sota和Mukteswar处于不同分支。HN蛋白为亲水性蛋白，分子质量约为62.71 ku，理论等电点(pI)为7.88，半衰期为30 h，不稳定系数为30.44，脂肪系数为85.48；该蛋白主要分布在线粒体和细胞质中，无信号肽，含有1个跨膜结构、5个潜在的N-糖基化位点、105个O-糖基化位点、13个半胱氨酸残基和75个磷酸化位点。HN蛋白二级结构、三级结构预测以无规则卷曲占比最高，其次为β-折叠和α-螺旋；B细胞抗原表位预测显示，HN蛋白含有10个抗原表位(氨基酸长度≥7)。【结论】上海地区PPMV-1流行株属于NDV强毒株的Class Ⅱ群Ⅵ.2.1.1.2.2亚型，其HN蛋白具有较好的抗原表位，可作为PPMV-1疫苗研制和抗病毒治疗的靶蛋白。本研究结果为PPMV-1 HN基因遗传进化、蛋白表达、新型疫苗研发和抗病毒药物的筛选等提供理论依据。

关键词：鸽Ⅰ型副黏病毒(PPMV-1);HN基因')">HN基因;遗传进化分析;生物信息学分析

基金资助：上海市肉鸽产业技术体系建设项目(沪农科产字[2022]第12号)