基于转录组测序筛选浙籽鹅F2代繁殖性状相关候选基因

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第11期北京时间：

作者：岳山, 赵秀华, 孙金艳, 彭福刚, 张元良, 李满雨, 刘国君

单位：1. 黑龙江省农业科学院博士后科研工作站, 哈尔滨 150086;2. 黑龙江省农业科学院畜牧研究所, 哈尔滨 150086

摘要：【目的】以浙东白鹅(♂)与浙籽鹅F1代(♀)杂交产生的浙籽鹅F2代母鹅为研究对象，分析浙籽鹅F2代产蛋期和休产期血液转录组数据，筛选浙籽鹅F2代繁殖性状相关的候选基因，为杂交鹅的繁殖调控提供参考。【方法】采集浙籽鹅F2代产蛋期和休产期血液样本，利用Illumina NovaSeq 6000测序平台进行转录组测序(RNA-Seq)分析。利用DESeq筛选差异表达基因(DEGs)，对其进行GO功能和KEGG通路富集分析，筛选与繁殖性状相关的基因。随机挑选6个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证。【结果】转录组测序结果显示，在产蛋期与休产期两个比较组中存在差异表达的基因4 576个，其中上调基因1 821个，下调基因2 755个。GO功能富集分析显示，共富集到9 643个GO条目，在生物过程中主要富集在钙离子跨膜转运的正调节、吞噬作用的调节、阳离子跨膜转运的正向调节等条目；在分子功能上主要富集在转移酶活性、催化活性、嘌呤核苷三磷酸结合等条目；在细胞组分中主要富集在细胞内。KEGG通路富集分析显示，共富集到157条通路，主要富集在果糖和甘露糖代谢、烟酸盐和烟酰胺代谢、氨基糖和核苷酸糖代谢等通路，筛选出ADCY5、CD44、CCND1是与繁殖性状相关的候选基因。实时荧光定量PCR结果与转录组测序趋势相符合，证实转录组测序结果可靠。【结论】本研究通过转录组测序筛选到3个(ADCY5、CD44、CCND1)与繁殖性状相关的候选基因，为研究浙籽鹅F2代繁殖性状相关基因的功能及后续分子调控机制提供依据。

关键词：浙籽鹅F2代;转录组;信号通路;候选基因

基金资助：黑龙江省博士后面上项目(LBH-Z22261)；黑龙江省农业科学院引进人才科研启动金项目；国家现代水禽产业技术体系专项(CARS-42-24)；黑龙江省农业科学院科技创新跨越工程项目(CX22YQ21)