1株携带多黏菌素耐药基因mcr-1的多重耐药大肠杆菌全基因组测序及分析

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第12期北京时间：

作者：杨璟珂, 杨思婕, 刘冉, 张铁, 王春光

单位：河北农业大学动物医学院, 保定 071001

摘要：【目的】了解临床分离的大肠杆菌的耐药性和毒力，为后续禽大肠杆菌病的临床防治提供参考。【方法】本研究通过菌体形态学观察和分子生物学手段对临床分离的1株鸡源病原菌进行分离纯化鉴定，通过药敏试验了解分离菌株的耐药性，利用Illumina NovaSeq 测序平台对分离菌株进行全基因组测序。【结果】分离菌株在麦康凯琼脂培养基上呈现粉红色圆形、光滑的菌落，镜检为革兰阴性杆菌，16S rDNA测序结果显示，与GenBank数据库已登录的大肠杆菌(登录号：NR_024570.1)相似性＞98%，经mcr-1基因特异性引物PCR扩增发现，分离的大肠杆菌携带多黏菌素耐药基因mcr-1。药敏试验结果显示，该分离菌株对青霉素类、头孢菌素类、氨基糖苷类、多肽类等12类抗菌药耐药，仅对氯霉素和米诺环素敏感，表现为多重耐药；分离菌株基因组总长为5 057 884 bp；基于KEGG、COG、GO、CAZy等数据库的基因功能注释分析表明，该菌株具备完整的氨基酸转运系统、细胞增殖与分化机制以及代谢功能；通过与CARD和VFDB数据库比对发现，该菌株具有效应器分泌系统、鞭毛、脑内皮侵袭素等毒力基因，且该菌株携带氨基糖苷类、磺胺类、喹诺酮类、肽类、四环素类和β-内酰胺类等多种抗菌药物的耐药基因，这些基因使该菌株表现出较强的毒力与多重耐药性。【结论】本研究分离获得1株鸡源携带mcr-1基因的大肠杆菌，具有多重耐药性与高毒力特征，其基因组结构与环境适应能力共同促成了其强致病性。本研究结果为禽大肠杆菌病的预防和治疗提供了一定的数据参考。

关键词：大肠杆菌;全基因组测序;基因功能注释;耐药性

基金资助：国家自然科学基金(32473072)；河北省现代农业产业技术体系专项资金(HBCT2024240207、HBCT2024250206)