湖南部分地区肝片吸虫群体的单倍型多样性特征与遗传分化模式研究

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第12期北京时间：

作者：李中波, 胡辉, 罗世民, 杨甜, 苏五珍, 黄翠琴

单位：1. 怀化职业技术学院, 怀化 418000;2. 武陵山区媒介生物抗药性检测及共生菌利用重点实验室, 怀化 418000;3. 龙岩学院生命科学学院, 龙岩 364012;4. 福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室, 龙岩 364012

摘要：【目的】探究湖南地区肝片吸虫的单倍型多样性(Hd)、遗传分化及种群扩张情况，并阐明其种系发育关系。【方法】试验以采自湖南张家界、怀化、邵阳、娄底、永州及湘西6个地区的36株肝片吸虫为研究对象，通过PCR扩增其细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(cox1)、内转录间隔Ⅰ区(ITS-1)基因序列并测序。利用ClustalX、Dnasp 5.0和Network 4.6软件分析湖南6个地区肝片吸虫的单倍型多样性；运用Dnasp 5.0和Arlequin version 3.0软件探究肝片吸虫的遗传分化及种群扩张状况，并利用ClustalX、PhyML 3.0软件分析其种系发育关系。【结果】肝片吸虫cox1基因序列呈AT碱基偏好，存在36个碱基突变位点，含有22个单倍型(A1～A22，Hd＝0.9571)，其遗传分化系数(Fst)为0.013～0.278，基因流(Nm)为-1.895～18.981，Tajima’s D值为-0.996～0.564，Fu’s Fs值为-2.452～0.391。肝片吸虫ITS-1基因序列呈GC碱基偏好，存在17个碱基突变位点，含有8个单倍型(B1～B8，Hd＝0.7762)，其Fst为-0.174～0.564，Nm为-5.932～7.103，Tajima’s D值为-1.337～1.389，Fu’s Fs值为-1.072～2.139。此外，36株肝片吸虫在各种系发育树中均共同聚类成一个分支。【结论】本研究显示湖南部分地区的肝片吸虫之间存在一定水平的单倍型多样性，且出现了不同程度的遗传分化，均经历了多次种群扩张事件，但它们之间亲缘关系仍较近。

关键词：肝片吸虫;单倍型多样性;遗传分化;种群扩张;种系发育关系

基金资助：国家自然科学基金区域创新联合基金重点项目(U22A20518)；湖南省教育厅优秀青年项目(23B1072)；湖南省自然科学基金项目(2022JJ50319)；福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室(ZDSYS2024008)；怀化市重点实验室项目(2023R2208)