ZBED6基因敲除对巴马香猪肺脏转录调控的影响

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第12期北京时间：

作者：陈欣雨, 王圣楠, 王丹丹, 马月辉, 蒋琳, 刘书琴

单位：1. 青岛农业大学动物科技学院, 青岛 266000;2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193

摘要：【目的】研究ZBED6基因敲除对巴马香猪肺脏基因表达谱的影响，进一步明确ZBED6基因缺失对巴马香猪肺脏功能的影响。【方法】采集8月龄雌性野生型(WT)和ZBED6基因敲除型(ZBED6-KO)巴马香猪肺脏组织并称重，用Trizol法提取肺脏组织RNA，经质量检测后建库(NEBNext® UltraTM)并测序(Illumina HiSeq 2500)。数据经Fastp v 0.23.4质控，TopHat和Cufflink分析差异基因，以|log2FoldChange|≥1和P≤0.05为标准筛选出差异表达基因。利用g:Profiler在线数据库对差异表达基因进行富集分析，利用实时荧光定量PCR对转录组测序(RNA-Seq)结果进行验证。【结果】与WT型巴马香猪相比，ZBED6-KO型巴马香猪的肺脏重量无显著变化(P＞0.05)。利用转录组测序在WT和ZBED6-KO型巴马香猪肺脏组织中共筛选出480个差异表达基因，其中上调基因125个，下调基因355个。上调基因主要富集在2条与免疫相关的通路，下调基因主要富集在代谢相关通路中。实时荧光定量PCR验证结果显示，上调和下调基因的表达变化趋势与RNA-Seq结果一致，证实了RNA-Seq数据的可靠性。【结论】ZBED6基因敲除影响了巴马香猪肺脏组织的基因表达谱，其中免疫相关基因普遍上调，而代谢相关基因显著下调。本研究结果为ZBED6在肺脏组织中的功能与作用提供更多的理论支持和证据，进一步填补了转录因子ZBED6在哺乳动物中肺脏方面作用机制的研究空白。

关键词：ZBED6基因')">ZBED6基因;基因敲除;转录组分析;肺脏;巴马香猪

基金资助：青岛农业大学博士启动基金(校20210021)