中国7个地方山羊品种的群体结构和优先保护分析

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第12期北京时间：

作者：阿剑鹏, 赵玉和田, 王明坤, 胡钟宇, 马月辉, 蒋琳, 叶绍辉, 何晓红

单位：1. 云南农业大学动物科学技术学院, 昆明 650201;2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193

摘要：【目的】本研究旨在对中国7个代表性地方山羊品种群体结构和优先保护次序进行分析，以促进山羊遗传资源保护和养羊业的可持续健康发展。【方法】收集了中国7个地方山羊品种,包括西藏山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊、湘东黑山羊、海南黑山羊、贵州黑山羊和罗平黄山羊，共63个个体的Illumina 50K芯片数据。通过主成分分析(PCA)、系统进化树和Admixture分析来了解群体结构，利用R Studio软件对PCA分析和Admixture分析结果进行可视化，利用在线网站iTOL对系统进化树进行可视化；将7个代表性品种整合为一个元种群，分析去除每个品种后总基因多样性和总等位基因多样性的变化，通过模拟评估各品种对合成群体在基因多样性和等位基因多样性方面的贡献比例确定品种保护的优先次序。【结果】群体结构分析中，PCA结果和系统进化树结果显示，7个品种明显分为3个分支，分别为西部&北部分支、东南分支和西南分支。西部&北部分支包括辽宁绒山羊、内蒙古绒山羊和西藏山羊；东南分支包括湘东黑山羊和海南黑山羊；西南分支包括贵州黑山羊和罗平黄山羊。Admixture分析结果显示，当K=3时，种群分布结构最佳。优先保护次序分析中，综合基因多样性和等位基因多样性的Z-score标准化结果表明，7个地方品种的优先保护次序从高到低依次为辽宁绒山羊、贵州黑山羊、西藏山羊、湘东黑山羊、内蒙古绒山羊、海南黑山羊、罗平黄山羊。【结论】中国地方山羊可分为3个分支，其中辽宁绒山羊、贵州黑山羊和西藏山羊为优先保护品种。本研究结果可为中国地方山羊遗传资源的管理提供依据，同时为中国地方山羊保护政策的优化提供参考。

关键词：山羊;地方品种;群体结构;遗传多样性贡献;优先保护

基金资助：国家重点研发项目(2022YFD1300201)；中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS01)