贵州地方猪TAS1R1基因多态性及其与生长性状的关联分析

来源：中国畜牧兽医杂志2025年第12期北京时间：

作者：贾雨轩, 韩飞, 曾广湖, 沈祥玉, 龚婷

单位：1. 贵州大学, 高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 贵阳 550025;2. 贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室, 贵阳 550025;3. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025

摘要：【目的】试验旨在分析味觉受体TAS1R1基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与贵州地方猪生长性状的关联性，为猪遗传育种提供有效的遗传标记和理论依据。【方法】采集262头贵州地方猪(从江香猪、江口萝卜猪、白洗猪、关岭猪、黔东花猪)耳组织样进行DNA提取，利用Primer Premier 6.0软件设计9对TAS1R1基因特异性引物，经PCR扩增后测序。使用DNAStar软件中SeqMan程序确定SNP位点，利用SHEsis在线软件分析SNP位点的群体遗传特性，采用SPSS 25.0软件中一般线性模型(GLM)对TAS1R1基因SNP位点与贵州地方猪生长性状进行关联分析，并结合RNAfold web server在线软件对TAS1R1基因SNP位点突变前后的mRNA二级结构进行预测。【结果】本研究筛选出2个SNP位点：g.67401632 G＞C(外显子3)和g.67404545 C＞T(外显子5)，均为错义突变，分别引起缬氨酸转变为亮氨酸及苏氨酸转变为甲硫氨酸。基因型分析结果显示，g.67401632 G＞C和g.67404545 C＞T位点的优势基因型均为CC。遗传多样性分析显示，g.67401632 G＞C位点在从江香猪、关岭猪和黔东花猪中表现为中度多态(0.25＜PIC＜0.50)，而在江口萝卜猪和白洗猪中表现为低度多态(PIC＜0.25)；g.67404545 C＞T位点在白洗猪中呈现低度多态。χ2检验结果显示，关岭猪g.67401632 G＞C位点符合哈代-温伯格平衡状态(P＜0.01)，而其他猪种g.67401632 G＞C和g.67404545 C＞T位点均偏离哈代-温伯格平衡状态(P＞0.05)。关联分析结果显示，8月龄从江香猪g.67401632 G＞C位点CC基因型个体的体长显著大于CG基因型(P＜0.05)，江口萝卜猪g.67401632 G＞C位点CG基因型个体的体长显著高于CC基因型(P＜0.05)；在1～5月龄从江香猪和黔东花猪中未发现SNP位点与体尺指标存在显著关联(P＞0.05)。二级结构预测结果显示，g.67401632 G＞C和g.67404545 C＞T位点增强了TAS1R1基因mRNA的二级结构稳定性。【结论】本研究共发现了2个错义突变，分别为g.67401632 G＞C(外显子3)、g.67404545 C＞T(外显子5)，其中g.67401632 G＞C位点与贵州地方猪生长性状存在一定的关联性，表明TAS1R1可作为猪遗传育种中生长性状的候选基因。

关键词：贵州地方猪种;TAS1R1基因')">TAS1R1基因;单核苷酸多态性;生长性状

基金资助：国家自然科学基金(32260836)；贵州省科学技术基金(黔科合基础[2020]1Y135)；贵州大学教学内容和课程体系改革(XJG2022028)