上海地区牛腹泻相关病毒的检测及分析

来源：中国畜牧兽医杂志2026年第2期北京时间：

作者：桂亚萍, 夏琦琦, 杨显超, 刘健, 徐平, 徐锋, 葛菲菲, 王建, 赵洪进

单位：上海市动物疫病预防控制中心，上海 201103

摘要：目的 了解上海地区牛腹泻相关病毒的流行情况，为牛腹泻的防控工作提供科学依据。 方法 应用RT-PCR方法对上海地区115份腹泻牛肛拭子样品进行牛轮状病毒（BRV）、牛肠道病毒（BEV）、牛冠状病毒（BCoV）、牛病毒性腹泻病毒（BVDV）检测，并对阳性病原部分基因序列进行测序和遗传进化分析。 结果 115份腹泻牛肛拭子样品BRV、BEV和BCoV检出率相同，均为1.74%（2/115），且均为单一感染；BVDV未检出。基于BRV VP7和VP4基因的遗传进化分析结果显示，检出的2株BRV的VP7基因与加拿大株FMV1078090相似性最高，为94.1%，与美国人源轮状病毒株3000015004亲缘关系较近，均属于G6型；VP4基因与中国株HB-3相似性最高，为98.2%，均属于P［11］型，因此2株BRV基因型为G6P［11］。基于BEV 5'-UTR基因的遗传进化分析结果显示，检出的2株BEV中1株与德国株D8-01相似性最高，为90.6%，同属于E型；1株与美国株Wye 8875相似性最高，为93.5%，同属于F型；2株BEV与中国流行株的亲缘关系均较远。基于BCoV N基因的遗传进化分析结果显示，检出的2株BCoV与大多数中国株和美国株聚为一个大的分支，均处于GⅡb基因群，亲缘关系较近，与美国株Mebus和疫苗株BC94亲缘关系较远。 结论 BRV、BEV和BCoV是引起上海地区牛腹泻的主要病毒性病原，其中BRV流行基因型为G6P［11］型，BEV流行基因型为E和F型，BCoV流行基因型为GⅡb型。本研究为上海地区牛腹泻防控策略的制定提供了科学依据。

关键词：牛;腹泻相关病毒;RT-PCR检测;遗传进化分析

基金资助：上海市奶业优势特色产业集群科研类项目（2023年）(沪农委〔2024〕74号);2023上海东方英才领军项目(LJ2023079)